96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1940 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1940  protein of the cupin superfamily-like protein  100 
 
 
131 aa  261  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3096  protein of unknown function DUF861 cupin_3  53.7 
 
 
120 aa  120  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966058  normal  0.459198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5714  protein of unknown function DUF861 cupin_3  52.68 
 
 
116 aa  107  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.61 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0498  protein of unknown function DUF861, cupin_3  53.85 
 
 
116 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5899  protein of unknown function DUF861, cupin_3  52.31 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0992  protein of unknown function DUF861, cupin_3  41.9 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0974  protein of unknown function DUF861, cupin_3  46.07 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.320847  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  42.05 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3842  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.26 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656555  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.58 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1243  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.22 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.78 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1093  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.07 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0990  hypothetical protein  31.07 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.154522 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0624  hypothetical protein  34.62 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.819765  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1145  hypothetical protein  34.62 
 
 
174 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.212798  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1808  hypothetical protein  34.62 
 
 
174 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0614  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.11 
 
 
116 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6071  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.37 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1624  hypothetical protein  33.65 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2491  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.07 
 
 
115 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415528  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1330  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.45 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335699  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0842  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1060  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0821  hypothetical protein  30.93 
 
 
149 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.79703  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  39.44 
 
 
115 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5081  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.1 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2357  hypothetical protein  34.62 
 
 
609 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  35.35 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6574  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.96 
 
 
114 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.647379 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4966  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.63 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0418481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1806  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.85 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2474  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0042  hypothetical protein  29.29 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28380  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  41.54 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0807  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.18 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0360  hypothetical protein  28.97 
 
 
163 aa  47.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4028  hypothetical protein  32.18 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0796  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.18 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7505  hypothetical protein  32.61 
 
 
117 aa  47  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0868  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.07 
 
 
113 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470118  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0047  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.77 
 
 
119 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0745  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.41 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4007  hypothetical protein  28.28 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0918  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.29 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0754701  normal  0.435909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0290  protein of unknown function DUF861, cupin_3  38.46 
 
 
227 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4660  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.03 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.894659  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0771  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.03 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356795  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4595  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.43 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0443354 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0904  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.29 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7582  normal  0.40632 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0453  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.03 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0932  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.03 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0226  hypothetical protein  27.47 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5535  hypothetical protein  34.78 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110951  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2676  hypothetical protein  31.31 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0142789 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5486  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.09 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.03 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0697  hypothetical protein  31.03 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.895833  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  30.77 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.82 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6090  hypothetical protein  31.48 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0874  hypothetical protein  32.29 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0771767  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4665  hypothetical protein  31.82 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777876  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7526  hypothetical protein  32.98 
 
 
126 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190702  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4332  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.9 
 
 
162 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4529  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.82 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241247  normal  0.339292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70170  hypothetical protein  31.48 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3449  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.34 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1112  protein of unknown function DUF861 cupin_3  25.81 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143177  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4304  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.21 
 
 
113 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.631594  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1693  hypothetical protein  34 
 
 
114 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0191  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.44 
 
 
119 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0091  hypothetical protein  26.37 
 
 
121 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0236  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.78 
 
 
119 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0244  hypothetical protein  24.73 
 
 
237 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5279  hypothetical protein  34.44 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5189  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.44 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  0.130139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2907  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.43 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0909  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.48 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3784  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.68 
 
 
222 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5331  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.44 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.038012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0964  protein of unknown function DUF861, cupin_3  24.11 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.179543  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0161  hypothetical protein  24.73 
 
 
237 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191842  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.09 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2742  hypothetical protein  28.09 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5064  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.31 
 
 
149 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3163  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.74 
 
 
115 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230079  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5000  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.3 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883571  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1483  hypothetical protein  36.92 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171215  hitchhiker  0.000969806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  25.84 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2618  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.33 
 
 
116 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.813991  normal  0.532352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.66 
 
 
128 aa  40.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.17 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.838844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>