89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5064 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5064  protein of unknown function DUF861 cupin_3  100 
 
 		 149 aa  306  6.999999999999999e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  100 
 
 		 144 aa  296  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  0.0542414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5486  protein of unknown function DUF861 cupin_3  58.39 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1806  protein of unknown function DUF861 cupin_3  56.85 
 
 		 150 aa  177  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0990  hypothetical protein  56.62 
 
 		 151 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.154522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1093  protein of unknown function DUF861, cupin_3  55.88 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5081  protein of unknown function DUF861 cupin_3  55.15 
 
 		 151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  43.65 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4595  protein of unknown function DUF861 cupin_3  42.97 
 
 		 163 aa  105  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0443354 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1624  hypothetical protein  49.11 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4332  protein of unknown function DUF861 cupin_3  41.79 
 
 		 162 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2357  hypothetical protein  47.32 
 
 		 609 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0624  hypothetical protein  44.72 
 
 		 138 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.819765  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1808  hypothetical protein  44.72 
 
 		 174 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1145  hypothetical protein  44.72 
 
 		 174 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.212798  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1060  hypothetical protein  43.9 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0842  hypothetical protein  43.9 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0360  hypothetical protein  40.71 
 
 		 163 aa  94  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.52 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3632  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4665  hypothetical protein  39.76 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777876  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.64 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.76 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4529  protein of unknown function DUF861, cupin_3  39.76 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241247  normal  0.339292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0771  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.55 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356795  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4660  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.55 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.894659  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.48 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15781  hypothetical protein  35.48 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.07 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1469  hypothetical protein  33.87 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.278748  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1386  cupin superfamily protein  38.71 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.101999  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.19 
 
 		 252 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0932  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.14 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.14 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0453  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.14 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0161  hypothetical protein  31.58 
 
 		 237 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2687  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.94 
 
 		 240 aa  50.4  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28380  hypothetical protein  36.9 
 
 		 114 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0959  cupin superfamily protein  35.48 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0904  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.78 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7582  normal  0.40632 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15631  hypothetical protein  32.26 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2474  hypothetical protein  37.35 
 
 		 114 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0047  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.89 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1631  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.65 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  27.62 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0874  hypothetical protein  34.78 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0771767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3842  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.58 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656555  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1704  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.65 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3083  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.94 
 
 		 296 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0651  hypothetical protein  32.26 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  27.62 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4308  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.87 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0121771  normal  0.0723845 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4304  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35 
 
 		 113 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.631594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2676  hypothetical protein  32.97 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4246  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.87 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0807  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.94 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  28.89 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0659  hypothetical protein  34.43 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.42337  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5714  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.58 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4028  hypothetical protein  34.94 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0796  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.94 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0244  hypothetical protein  30.53 
 
 		 237 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  30.59 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0779  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.92 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0364385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0918  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.7 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0754701  normal  0.435909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0714  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.48 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.729837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0614  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.7 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6271  hypothetical protein  32.31 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.11 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1097  hypothetical protein  29.03 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.714468  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0697  hypothetical protein  34.52 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.895833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7526  hypothetical protein  29.91 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190702  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10461  hypothetical protein  33.87 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3163  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.29 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230079  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.11 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11190  predicted enzyme of the cupin superfamily  29.03 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.11 
 
 		 123 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1414  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.03 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000022631  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1616  hypothetical protein  29.03 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0909  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.92 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6071  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.41 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2651  hypothetical protein  30.59 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000014442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9903  predicted protein  33.33 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0288299  normal  0.909152 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3784  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.3 
 
 		 222 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1940  protein of the cupin superfamily-like protein  29.31 
 
 		 131 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0091  hypothetical protein  27.78 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0226  hypothetical protein  27.78 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5535  hypothetical protein  28.16 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  28.97 
 
 		 119 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>