23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0974 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0974  protein of unknown function DUF861, cupin_3  100 
 
 
95 aa  189  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.320847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0992  protein of unknown function DUF861, cupin_3  98.95 
 
 
113 aa  187  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0498  protein of unknown function DUF861, cupin_3  60.64 
 
 
116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5899  protein of unknown function DUF861, cupin_3  56.38 
 
 
116 aa  103  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5714  protein of unknown function DUF861 cupin_3  51.58 
 
 
116 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3096  protein of unknown function DUF861 cupin_3  50 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966058  normal  0.459198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1940  protein of the cupin superfamily-like protein  46.07 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.96 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2676  hypothetical protein  36.62 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0142789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2618  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.68 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.813991  normal  0.532352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4304  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.25 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.631594  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3632  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.78 
 
 
167 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  31.18 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4966  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.25 
 
 
117 aa  42.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0418481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0745  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.38 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0868  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.22 
 
 
113 aa  42  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470118  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6271  hypothetical protein  32.86 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0874  hypothetical protein  30 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0771767  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1330  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.11 
 
 
117 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335699  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0909  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.68 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3449  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.31 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0918  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.43 
 
 
113 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0754701  normal  0.435909 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2651  hypothetical protein  29.29 
 
 
121 aa  40  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000014442  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>