50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3632 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3632  protein of unknown function DUF861 cupin_3  100 
 
 		 167 aa  327  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  43.69 
 
 		 170 aa  91.7  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4595  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.14 
 
 		 163 aa  84.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0443354 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4332  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.46 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0360  hypothetical protein  38.79 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5081  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.5 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1093  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.33 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0990  hypothetical protein  32.5 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.154522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5486  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.45 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1624  hypothetical protein  34.86 
 
 		 138 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0624  hypothetical protein  34.86 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.819765  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1808  hypothetical protein  34.86 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1145  hypothetical protein  34.86 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.212798  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2357  hypothetical protein  36.36 
 
 		 609 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1806  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.61 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1060  hypothetical protein  35.35 
 
 		 123 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0842  hypothetical protein  35.35 
 
 		 123 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  0.0542414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5064  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.36 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0651  hypothetical protein  34.21 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5714  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.96 
 
 		 116 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1097  hypothetical protein  33.82 
 
 		 92 aa  49.7  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.714468  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9903  predicted protein  40 
 
 		 71 aa  50.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0288299  normal  0.909152 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15781  hypothetical protein  29.03 
 
 		 91 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15631  hypothetical protein  30.65 
 
 		 91 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1631  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.71 
 
 		 87 aa  47  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1469  hypothetical protein  25.81 
 
 		 91 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.278748  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1704  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.71 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0992  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.48 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.87 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10461  hypothetical protein  33.72 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3096  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966058  normal  0.459198 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  45.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1533  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.76 
 
 		 91 aa  44.7  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000391778  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1414  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.26 
 
 		 89 aa  44.3  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000022631  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0974  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.78 
 
 		 95 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.320847  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0042  hypothetical protein  26.8 
 
 		 120 aa  43.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0659  hypothetical protein  38.18 
 
 		 91 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.42337  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1386  cupin superfamily protein  35.48 
 
 		 91 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.101999  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0621  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.81 
 
 		 130 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1616  hypothetical protein  30.65 
 
 		 90 aa  42  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0714  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.1 
 
 		 109 aa  42  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.729837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3784  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.11 
 
 		 222 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.31 
 
 		 117 aa  41.6  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0868  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.48 
 
 		 113 aa  41.6  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470118  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.43 
 
 		 91 aa  41.6  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3449  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.93 
 
 		 113 aa  41.2  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1693  hypothetical protein  28.95 
 
 		 114 aa  40.8  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0959  cupin superfamily protein  33.87 
 
 		 91 aa  40.8  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>