43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0244 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0244  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  484  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0161  hypothetical protein  89.87 
 
 		 237 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5906  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.53 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.892594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6063  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.26 
 
 		 244 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6271  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.87 
 
 		 244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6360  protein of unknown function DUF861, cupin_3  40.26 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6673  protein of unknown function DUF861, cupin_3  40.43 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6438  protein of unknown function DUF861, cupin_3  40.43 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1650  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.55 
 
 		 239 aa  154  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.350548  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4422  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.6 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3083  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.71 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2687  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.61 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.43 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0637  hypothetical protein  27.49 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.046264  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2290  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27.32 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.371915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0097  hypothetical protein  32.99 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4843  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.41 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.77141  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2491  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.05 
 
 		 115 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415528  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4606  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.65 
 
 		 124 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.04 
 
 		 117 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4595  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.02 
 
 		 163 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0443354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2907  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.72 
 
 		 117 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1624  hypothetical protein  32.32 
 
 		 138 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1060  hypothetical protein  31.91 
 
 		 123 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0842  hypothetical protein  31.91 
 
 		 123 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3096  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.43 
 
 		 120 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966058  normal  0.459198 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0624  hypothetical protein  32.32 
 
 		 138 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.819765  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1808  hypothetical protein  31.91 
 
 		 174 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1145  hypothetical protein  31.91 
 
 		 174 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.212798  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4332  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.47 
 
 		 162 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5064  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.53 
 
 		 149 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4966  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.42 
 
 		 117 aa  45.8  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0418481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.53 
 
 		 144 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  0.0542414 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3024  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.75 
 
 		 124 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00331954  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1428  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.47 
 
 		 127 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4423  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.45 
 
 		 118 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.82 
 
 		 91 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2357  hypothetical protein  32.32 
 
 		 609 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.87 
 
 		 117 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.919827  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.17 
 
 		 117 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.838844 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0868  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.87 
 
 		 113 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470118  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1940  protein of the cupin superfamily-like protein  24.73 
 
 		 131 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0614  protein of unknown function DUF861, cupin_3  25.89 
 
 		 116 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>