26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6438 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6438  protein of unknown function DUF861, cupin_3  100 
 
 		 260 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6673  protein of unknown function DUF861, cupin_3  100 
 
 		 260 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6271  protein of unknown function DUF861 cupin_3  96.73 
 
 		 244 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6063  protein of unknown function DUF861 cupin_3  91.02 
 
 		 244 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6360  protein of unknown function DUF861, cupin_3  84.08 
 
 		 244 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5906  protein of unknown function DUF861 cupin_3  74.37 
 
 		 244 aa  364  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.892594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1650  protein of unknown function DUF861 cupin_3  74.26 
 
 		 239 aa  357  8e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.350548  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0244  hypothetical protein  40.43 
 
 		 237 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0161  hypothetical protein  39.13 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4422  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.81 
 
 		 236 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.78 
 
 		 252 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2687  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.16 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3083  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.19 
 
 		 296 aa  95.9  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0097  hypothetical protein  29.46 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0637  hypothetical protein  34.29 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.046264  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2290  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.64 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.371915 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  32.69 
 
 		 119 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4843  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.18 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.77141  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  32.35 
 
 		 123 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.62 
 
 		 117 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1428  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.38 
 
 		 127 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6488  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.33 
 
 		 148 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5735  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.33 
 
 		 148 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6271  hypothetical protein  32.95 
 
 		 115 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0047  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.77 
 
 		 119 aa  42.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3096  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.64 
 
 		 120 aa  42.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966058  normal  0.459198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>