29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4422 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4422  protein of unknown function DUF861 cupin_3  100 
 
 		 236 aa  474  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0244  hypothetical protein  34.6 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6063  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.28 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6271  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.81 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6673  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.81 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6438  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.81 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0161  hypothetical protein  32.91 
 
 		 237 aa  141  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5906  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.35 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.892594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6360  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.19 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1650  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.76 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.350548  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2687  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.94 
 
 		 240 aa  99  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.05 
 
 		 252 aa  92  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0637  hypothetical protein  28.79 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.046264  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2290  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.79 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.371915 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3083  protein of unknown function DUF861 cupin_3  25.82 
 
 		 296 aa  72  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0097  hypothetical protein  31.25 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0821  hypothetical protein  27.36 
 
 		 149 aa  48.9  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.79703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3909  hypothetical protein  31.96 
 
 		 150 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1093  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.57 
 
 		 151 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5081  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.85 
 
 		 151 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0990  hypothetical protein  26.79 
 
 		 151 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.154522 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1516  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.41 
 
 		 123 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0042  hypothetical protein  26.85 
 
 		 120 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4606  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30 
 
 		 124 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.1 
 
 		 117 aa  43.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4007  hypothetical protein  25.81 
 
 		 128 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.41 
 
 		 170 aa  42.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  29.7 
 
 		 123 aa  41.6  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6271  hypothetical protein  28.41 
 
 		 115 aa  41.6  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>