104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1516 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1516  protein of unknown function DUF861 cupin_3  100 
 
 
123 aa  255  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.02 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1082  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.25 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000597126  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1150  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.29 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00929773  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3501  hypothetical protein  30.77 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.77 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.77 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3108  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.77 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312601  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1090  hypothetical protein  31.25 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00838125  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1184  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.25 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.831048  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3205  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.25 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.02 
 
 
123 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1428  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.02 
 
 
127 aa  60.8  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.02 
 
 
123 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.33 
 
 
120 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0091  hypothetical protein  30.3 
 
 
121 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.58 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5279  hypothetical protein  30.53 
 
 
119 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2651  hypothetical protein  31.25 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000014442  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  37.63 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2491  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.62 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415528  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5331  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.53 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.038012 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5189  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.53 
 
 
119 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  0.130139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0191  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.53 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0226  hypothetical protein  28.72 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1042  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.63 
 
 
127 aa  57  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284329  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3449  protein of unknown function DUF861, cupin_3  38.03 
 
 
113 aa  57  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  29.46 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70170  hypothetical protein  29.41 
 
 
120 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0236  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.29 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3024  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28 
 
 
124 aa  55.1  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00331954  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0964  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.72 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.179543  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6090  hypothetical protein  27.45 
 
 
120 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  28.57 
 
 
126 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0042  hypothetical protein  36.11 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5535  hypothetical protein  28.12 
 
 
120 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110951  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1112  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.26 
 
 
120 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143177  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7505  hypothetical protein  26.09 
 
 
117 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1624  hypothetical protein  31.43 
 
 
138 aa  50.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2907  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.99 
 
 
117 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5000  protein of unknown function DUF861 cupin_3  23.16 
 
 
118 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883571  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6071  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.57 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0097  hypothetical protein  32.5 
 
 
260 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0624  hypothetical protein  31.43 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.819765  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2357  hypothetical protein  31.73 
 
 
609 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7526  hypothetical protein  30.38 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190702  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0990  hypothetical protein  34.91 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.154522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4665  hypothetical protein  30.59 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777876  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28380  hypothetical protein  29.21 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0842  hypothetical protein  30.48 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1145  hypothetical protein  31.43 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.212798  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1060  hypothetical protein  30.48 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1808  hypothetical protein  31.43 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4529  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.59 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241247  normal  0.339292 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.59 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4660  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.59 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.894659  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0771  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.59 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356795  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0697  hypothetical protein  34.12 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.895833  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1093  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.69 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4606  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.65 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  23.44 
 
 
252 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2474  hypothetical protein  30.59 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4423  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.8 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728084  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0453  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.41 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0932  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.41 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.73 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.41 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3163  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.94 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230079  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6639  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.59 
 
 
120 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5674  hypothetical protein  36.23 
 
 
118 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4028  hypothetical protein  29.41 
 
 
114 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0796  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.41 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1330  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.85 
 
 
117 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335699  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5486  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.3 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0807  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.41 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.51 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  28.92 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1386  cupin superfamily protein  32.81 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.101999  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4214  protein of unknown function DUF861, cupin_3  40.82 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1693  hypothetical protein  31.63 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5197  protein of unknown function DUF861 cupin_3  26.47 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.54 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.919827  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5081  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.81 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0360  hypothetical protein  29.13 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10461  hypothetical protein  31.25 
 
 
90 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2785  hypothetical protein  25 
 
 
114 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.77 
 
 
117 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.838844 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0821  hypothetical protein  28.75 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.79703  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0868  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.58 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470118  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  27.71 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.77 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4422  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.41 
 
 
236 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1243  protein of unknown function DUF861 cupin_3  26.92 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0909  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.57 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4007  hypothetical protein  26.61 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1806  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.77 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0959  cupin superfamily protein  29.69 
 
 
91 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.77 
 
 
128 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  23.97 
 
 
115 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0401  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27.72 
 
 
113 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>