26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6063 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6063  protein of unknown function DUF861 cupin_3  100 
 
 		 244 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6271  protein of unknown function DUF861 cupin_3  90.57 
 
 		 244 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6438  protein of unknown function DUF861, cupin_3  91.02 
 
 		 260 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6673  protein of unknown function DUF861, cupin_3  91.02 
 
 		 260 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6360  protein of unknown function DUF861, cupin_3  85.66 
 
 		 244 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5906  protein of unknown function DUF861 cupin_3  72.54 
 
 		 244 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.892594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1650  protein of unknown function DUF861 cupin_3  75.11 
 
 		 239 aa  359  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.350548  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0244  hypothetical protein  40.26 
 
 		 237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0161  hypothetical protein  39.06 
 
 		 237 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4422  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.28 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  38.97 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2687  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.85 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3083  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.63 
 
 		 296 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0637  hypothetical protein  32.26 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.046264  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2290  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.26 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.371915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0097  hypothetical protein  24.1 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  30.43 
 
 		 119 aa  49.3  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6488  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.52 
 
 		 148 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5735  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.52 
 
 		 148 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4843  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.27 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.77141  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  31.73 
 
 		 123 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.37 
 
 		 117 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6271  hypothetical protein  36.23 
 
 		 115 aa  45.4  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1428  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.11 
 
 		 127 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3096  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.64 
 
 		 120 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966058  normal  0.459198 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7526  hypothetical protein  27.72 
 
 		 126 aa  42  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190702  normal  0.789293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>