111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1428 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1428  protein of unknown function DUF861 cupin_3  100 
 
 
127 aa  262  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0091  hypothetical protein  36.7 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0226  hypothetical protein  36.19 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0236  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.78 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3501  hypothetical protein  32.41 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2651  hypothetical protein  45.45 
 
 
121 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000014442  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  38.1 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.25 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.25 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70170  hypothetical protein  36.73 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  37.93 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6090  hypothetical protein  35.71 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7526  hypothetical protein  36.27 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190702  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3108  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.36 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312601  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5535  hypothetical protein  30.83 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110951  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2907  protein of unknown function DUF861 cupin_3  43.21 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  42.31 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3024  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.8 
 
 
124 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00331954  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5331  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.038012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0191  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5279  hypothetical protein  36 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6071  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.04 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5189  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  0.130139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.34 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.25 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1082  protein of unknown function DUF861, cupin_3  38.27 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000597126  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.46 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3205  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.46 
 
 
121 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1090  hypothetical protein  37.04 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00838125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1150  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.04 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00929773  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1184  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.04 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.831048  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6639  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0964  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.18 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.179543  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1112  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.21 
 
 
120 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143177  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.84 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.919827  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.89 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.838844 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0042  hypothetical protein  37.11 
 
 
120 aa  62.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4966  protein of unknown function DUF861, cupin_3  40.74 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0418481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  39.19 
 
 
119 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3449  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.53 
 
 
113 aa  60.8  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2290  protein of unknown function DUF861, cupin_3  41.56 
 
 
241 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.371915 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0637  hypothetical protein  41.56 
 
 
241 aa  60.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.046264  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1516  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.02 
 
 
123 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4423  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.75 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728084  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1755  hypothetical protein  41.03 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0401  protein of unknown function DUF861, cupin_3  41.03 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1042  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.57 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284329  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5674  hypothetical protein  36.25 
 
 
118 aa  57  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0821  hypothetical protein  32.99 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.79703  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2491  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.14 
 
 
115 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415528  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5000  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.14 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883571  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5197  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.91 
 
 
114 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0097  hypothetical protein  31.96 
 
 
260 aa  53.9  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.37 
 
 
252 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2785  hypothetical protein  31.65 
 
 
114 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0868  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.43 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470118  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.21 
 
 
114 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0161  hypothetical protein  30.56 
 
 
237 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191842  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3083  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.33 
 
 
296 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4007  hypothetical protein  31.63 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0453  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.89 
 
 
114 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0932  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.89 
 
 
114 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.89 
 
 
114 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7505  hypothetical protein  32.26 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4660  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.21 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.894659  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0771  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.21 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356795  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4665  hypothetical protein  32.89 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777876  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4028  hypothetical protein  32.89 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4529  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.89 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241247  normal  0.339292 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0807  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.89 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2687  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.86 
 
 
240 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4843  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31 
 
 
230 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.77141  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0745  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.43 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0796  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.89 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1243  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.08 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28380  hypothetical protein  34.21 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1693  hypothetical protein  29.2 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2474  hypothetical protein  34.21 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.29 
 
 
91 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1330  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.49 
 
 
117 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335699  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3842  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.58 
 
 
127 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656555  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0904  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7582  normal  0.40632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  32 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0918  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0754701  normal  0.435909 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6271  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.38 
 
 
244 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0874  hypothetical protein  30.67 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0771767  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0244  hypothetical protein  29.47 
 
 
237 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6438  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.38 
 
 
260 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6673  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.38 
 
 
260 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376834  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5906  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.61 
 
 
244 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.892594  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6360  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.65 
 
 
244 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15781  hypothetical protein  25.71 
 
 
91 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6063  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.11 
 
 
244 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1631  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27.78 
 
 
87 aa  43.5  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4304  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.33 
 
 
113 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.631594  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1386  cupin superfamily protein  31.51 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.101999  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1704  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.43 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0909  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.33 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>