46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5906 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5906  protein of unknown function DUF861 cupin_3  100 
 
 		 244 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.892594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6360  protein of unknown function DUF861, cupin_3  75.41 
 
 		 244 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1650  protein of unknown function DUF861 cupin_3  74.9 
 
 		 239 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.350548  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6271  protein of unknown function DUF861 cupin_3  73.36 
 
 		 244 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6673  protein of unknown function DUF861, cupin_3  74.37 
 
 		 260 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6438  protein of unknown function DUF861, cupin_3  74.37 
 
 		 260 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6063  protein of unknown function DUF861 cupin_3  72.54 
 
 		 244 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0244  hypothetical protein  38.53 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0161  hypothetical protein  38.1 
 
 		 237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  40.65 
 
 		 252 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4422  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.35 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2687  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.11 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3083  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.73 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0637  hypothetical protein  28.65 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.046264  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2290  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.61 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.371915 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.82 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0097  hypothetical protein  35.56 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  52.8  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5735  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.59 
 
 		 148 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6488  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.59 
 
 		 148 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4843  protein of unknown function DUF861 cupin_3  23.98 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.77141  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6271  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  34.23 
 
 		 114 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4423  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.2 
 
 		 118 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  34.23 
 
 		 114 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2491  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.34 
 
 		 115 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415528  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0821  hypothetical protein  26.92 
 
 		 149 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.79703  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0047  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.11 
 
 		 119 aa  46.6  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2676  hypothetical protein  34.26 
 
 		 114 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1428  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.61 
 
 		 127 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0918  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.59 
 
 		 113 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0754701  normal  0.435909 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2651  hypothetical protein  29.47 
 
 		 121 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000014442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3096  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.81 
 
 		 120 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966058  normal  0.459198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0874  hypothetical protein  35.37 
 
 		 113 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0771767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  29.27 
 
 		 126 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0904  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.37 
 
 		 113 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7582  normal  0.40632 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7526  hypothetical protein  29.76 
 
 		 126 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190702  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  26.8 
 
 		 128 aa  43.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4304  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.59 
 
 		 113 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.631594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0868  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.41 
 
 		 113 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470118  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5081  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.97 
 
 		 151 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3024  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.59 
 
 		 124 aa  42.7  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00331954  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2907  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.49 
 
 		 117 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5714  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.09 
 
 		 116 aa  42.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.13 
 
 		 123 aa  42  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>