77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2687 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2687  protein of unknown function DUF861, cupin_3  100 
 
 
240 aa  486  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3083  protein of unknown function DUF861 cupin_3  50.42 
 
 
296 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  50.42 
 
 
252 aa  226  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0637  hypothetical protein  41.04 
 
 
241 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.046264  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2290  protein of unknown function DUF861, cupin_3  39.88 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.371915 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5906  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.11 
 
 
244 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.892594  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6063  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.85 
 
 
244 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0161  hypothetical protein  32.12 
 
 
237 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191842  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6360  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.85 
 
 
244 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6271  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.16 
 
 
244 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6673  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.16 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376834  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6438  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.16 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4422  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.94 
 
 
236 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0244  hypothetical protein  30.61 
 
 
237 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1650  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.82 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.350548  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4843  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.8 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.77141  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0097  hypothetical protein  28 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.91 
 
 
117 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2907  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.3 
 
 
117 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4966  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.1 
 
 
117 aa  55.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0418481 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  30.09 
 
 
123 aa  55.5  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  33.03 
 
 
126 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0821  hypothetical protein  28.87 
 
 
149 aa  52.4  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.79703  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.94 
 
 
144 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  0.0542414 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3024  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.25 
 
 
124 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00331954  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4423  protein of unknown function DUF861 cupin_3  26.85 
 
 
118 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728084  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5064  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.94 
 
 
149 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0796  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30 
 
 
114 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2491  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.57 
 
 
115 aa  49.3  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415528  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  25.93 
 
 
117 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.838844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0236  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32 
 
 
119 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1082  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.63 
 
 
121 aa  48.9  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000597126  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.89 
 
 
114 aa  48.5  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3501  hypothetical protein  29.75 
 
 
124 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1428  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.86 
 
 
127 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6071  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.19 
 
 
126 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.71 
 
 
123 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0807  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.89 
 
 
114 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0453  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.89 
 
 
114 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4660  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.89 
 
 
114 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.894659  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1184  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.32 
 
 
121 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.831048  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.87 
 
 
120 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0771  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.89 
 
 
114 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356795  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1150  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.32 
 
 
121 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00929773  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30 
 
 
114 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3205  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.32 
 
 
121 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1090  hypothetical protein  32.32 
 
 
121 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00838125  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0091  hypothetical protein  24.35 
 
 
121 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0932  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.89 
 
 
114 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4028  hypothetical protein  28.89 
 
 
114 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  26.61 
 
 
117 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.919827  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4529  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.89 
 
 
114 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241247  normal  0.339292 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3163  protein of unknown function DUF861, cupin_3  25.44 
 
 
115 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230079  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0226  hypothetical protein  24.35 
 
 
122 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4665  hypothetical protein  28.89 
 
 
114 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777876  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7526  hypothetical protein  28.7 
 
 
126 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190702  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.91 
 
 
121 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.91 
 
 
121 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2474  hypothetical protein  28.89 
 
 
114 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2651  hypothetical protein  29.27 
 
 
121 aa  46.2  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000014442  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5535  hypothetical protein  30.49 
 
 
120 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110951  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6090  hypothetical protein  32 
 
 
120 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4007  hypothetical protein  27.84 
 
 
128 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3108  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.59 
 
 
119 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312601  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.72 
 
 
123 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0697  hypothetical protein  29.07 
 
 
114 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.895833  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28380  hypothetical protein  29.07 
 
 
114 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70170  hypothetical protein  31 
 
 
120 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0191  protein of unknown function DUF861 cupin_3  25.77 
 
 
119 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5331  protein of unknown function DUF861 cupin_3  25.77 
 
 
119 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.038012 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5189  protein of unknown function DUF861, cupin_3  25.77 
 
 
119 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  0.130139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1806  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.36 
 
 
150 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5674  hypothetical protein  25 
 
 
118 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5279  hypothetical protein  25.77 
 
 
119 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  26.85 
 
 
115 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  28.71 
 
 
114 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6639  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.93 
 
 
120 aa  42  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>