36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2290 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2290  protein of unknown function DUF861, cupin_3  100 
 
 		 241 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.371915 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0637  hypothetical protein  97.1 
 
 		 241 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.046264  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2687  protein of unknown function DUF861, cupin_3  39.88 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.54 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3083  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.84 
 
 		 296 aa  93.6  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4843  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.71 
 
 		 230 aa  89.4  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.77141  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0244  hypothetical protein  27.32 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4422  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.79 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0161  hypothetical protein  26.9 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5906  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.61 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.892594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6063  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.26 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1428  protein of unknown function DUF861 cupin_3  41.56 
 
 		 127 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1650  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.65 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.350548  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6271  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.8 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6360  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.2 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6673  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.64 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6438  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.64 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0097  hypothetical protein  22.46 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2907  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.47 
 
 		 117 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.95 
 
 		 123 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4423  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.29 
 
 		 118 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5000  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.91 
 
 		 118 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.66 
 
 		 120 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.95 
 
 		 123 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.84 
 
 		 117 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1150  protein of unknown function DUF861 cupin_3  26.5 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4966  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.21 
 
 		 117 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0418481 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  31.17 
 
 		 126 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1082  protein of unknown function DUF861, cupin_3  26.5 
 
 		 121 aa  43.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000597126  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0621  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.33 
 
 		 130 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1806  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.41 
 
 		 150 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1184  protein of unknown function DUF861 cupin_3  25.64 
 
 		 121 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.831048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1090  hypothetical protein  25.64 
 
 		 121 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00838125  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7505  hypothetical protein  27.1 
 
 		 117 aa  42.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3501  hypothetical protein  29.82 
 
 		 124 aa  42  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2651  hypothetical protein  28.33 
 
 		 121 aa  42  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000014442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>