67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0621 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0621  protein of unknown function DUF861, cupin_3  100 
 
 		 130 aa  262  8.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.48 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3842  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.7 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656555  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0909  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.26 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.33 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  32.11 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5279  hypothetical protein  37.14 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0226  hypothetical protein  31.82 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0091  hypothetical protein  33.02 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6271  hypothetical protein  34.29 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5189  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.71 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  0.130139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5331  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.71 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0191  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.71 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0796  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.33 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1082  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.51 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000597126  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70170  hypothetical protein  36.11 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5535  hypothetical protein  30.36 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3108  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0236  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.71 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6090  hypothetical protein  36.11 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1150  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.39 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00929773  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0042  hypothetical protein  29.67 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0807  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.33 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3205  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.94 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1184  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.51 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.831048  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3501  hypothetical protein  27.27 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1090  hypothetical protein  31.51 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00838125  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4007  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2618  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.67 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.813991  normal  0.532352 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4028  hypothetical protein  32.05 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0964  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.08 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.179543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1112  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.67 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.05 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0637  hypothetical protein  28.92 
 
 		 241 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.046264  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4660  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.33 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.894659  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4665  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777876  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0771  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.33 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356795  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1093  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.52 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3784  protein of unknown function DUF861, cupin_3  26.6 
 
 		 222 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0453  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.05 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4529  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.33 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241247  normal  0.339292 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0932  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.05 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0821  hypothetical protein  31.88 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.79703  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.05 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15781  hypothetical protein  30.43 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3632  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.81 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  27.62 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3024  protein of unknown function DUF861, cupin_3  26.32 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00331954  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0097  hypothetical protein  28.72 
 
 		 260 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0047  protein of unknown function DUF861, cupin_3  25.35 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  27.72 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2290  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.33 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.371915 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1414  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.36 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000022631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1042  protein of unknown function DUF861, cupin_3  26.04 
 
 		 127 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284329  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  26.67 
 
 		 114 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0990  hypothetical protein  27.62 
 
 		 151 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.154522 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4606  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27.27 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.57 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15631  hypothetical protein  29.85 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3909  hypothetical protein  39.13 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6071  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.91 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0360  hypothetical protein  25.71 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2651  hypothetical protein  29.73 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000014442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6639  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.33 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0745  protein of unknown function DUF861 cupin_3  25 
 
 		 121 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>