38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0614 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0614  protein of unknown function DUF861, cupin_3  100 
 
 		 116 aa  239  7e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1940  protein of the cupin superfamily-like protein  32.11 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  26.97 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5714  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.67 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4595  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.79 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0443354 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.35 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.77 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.79 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3842  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.16 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656555  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0091  hypothetical protein  25 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5064  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.7 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.7 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  0.0542414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4332  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.55 
 
 		 162 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0226  hypothetical protein  25.86 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3096  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.3 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966058  normal  0.459198 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15781  hypothetical protein  32.26 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5279  hypothetical protein  27.59 
 
 		 119 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  28.38 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5535  hypothetical protein  29.25 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0360  hypothetical protein  27.27 
 
 		 163 aa  42.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5331  protein of unknown function DUF861 cupin_3  26.72 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038012 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0659  hypothetical protein  31.43 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.42337  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.33 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0244  hypothetical protein  25.89 
 
 		 237 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0161  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5189  protein of unknown function DUF861, cupin_3  26.72 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  0.130139 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15631  hypothetical protein  32.26 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1469  hypothetical protein  28.57 
 
 		 91 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.278748  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1386  cupin superfamily protein  30.26 
 
 		 91 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.101999  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10461  hypothetical protein  34.29 
 
 		 90 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.79 
 
 		 91 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0191  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.88 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0047  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27.4 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1426  ethanolamine utilisation EutQ family protein  30.56 
 
 		 209 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4304  protein of unknown function DUF861 cupin_3  26.47 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.631594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.43 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6271  hypothetical protein  27.94 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.43 
 
 		 123 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>