90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0659 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0659  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  187  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.42337  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4246  protein of unknown function DUF861 cupin_3  67.82 
 
 		 97 aa  126  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4308  protein of unknown function DUF861 cupin_3  67.82 
 
 		 97 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0121771  normal  0.0723845 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1386  cupin superfamily protein  59.55 
 
 		 91 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.101999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  61.11 
 
 		 91 aa  120  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10461  hypothetical protein  57.3 
 
 		 90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1616  hypothetical protein  62.07 
 
 		 90 aa  118  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0959  cupin superfamily protein  59.55 
 
 		 91 aa  117  7e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0651  hypothetical protein  62.07 
 
 		 90 aa  115  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0779  protein of unknown function DUF861 cupin_3  60 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0364385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0714  protein of unknown function DUF861, cupin_3  57.14 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.729837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  53.85 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1097  hypothetical protein  56.18 
 
 		 92 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.714468  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1533  protein of unknown function DUF861, cupin_3  54.95 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000391778  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1704  protein of unknown function DUF861 cupin_3  55.68 
 
 		 89 aa  100  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11190  predicted enzyme of the cupin superfamily  51.65 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1631  protein of unknown function DUF861, cupin_3  55.17 
 
 		 87 aa  97.8  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1414  protein of unknown function DUF861, cupin_3  59.15 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000022631  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9903  predicted protein  60.56 
 
 		 71 aa  94  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0288299  normal  0.909152 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15781  hypothetical protein  44 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1469  hypothetical protein  42.67 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.278748  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15631  hypothetical protein  42.67 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0997  protein of unknown function DUF861 cupin_3  45.83 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.66 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0796  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.36 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4529  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.36 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241247  normal  0.339292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4665  hypothetical protein  36.36 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777876  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0807  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.06 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0932  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.62 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0453  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.62 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.62 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4028  hypothetical protein  35.62 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4660  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.06 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.894659  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0771  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.06 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356795  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3163  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.97 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230079  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28380  hypothetical protein  29.67 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0697  hypothetical protein  32.97 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.895833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2474  hypothetical protein  32.88 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  41.27 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0990  hypothetical protein  35.96 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.154522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1093  protein of unknown function DUF861, cupin_3  39.34 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5081  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.96 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  36.92 
 
 		 114 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0624  hypothetical protein  36.51 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.819765  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1624  hypothetical protein  36.51 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2357  hypothetical protein  37.1 
 
 		 609 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  35.38 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0842  hypothetical protein  36.51 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1145  hypothetical protein  36.51 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.212798  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1060  hypothetical protein  36.51 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1808  hypothetical protein  36.51 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0904  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.85 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7582  normal  0.40632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5486  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.56 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1806  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.7 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.62 
 
 		 117 aa  47.4  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0360  hypothetical protein  39.34 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0047  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.49 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.7 
 
 		 170 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.82 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5064  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.43 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.43 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  0.0542414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4304  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.77 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.631594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0874  hypothetical protein  32.31 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0771767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  37.31 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.82 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.82 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4332  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.07 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4595  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.07 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0443354 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0918  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.77 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0754701  normal  0.435909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3632  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.18 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2618  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.07 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.813991  normal  0.532352 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0868  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.18 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470118  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.85 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1693  hypothetical protein  42.31 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0614  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.43 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1112  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.85 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.85 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3174  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.67 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00906812  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5674  hypothetical protein  45.83 
 
 		 118 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2491  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.54 
 
 		 115 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415528  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1042  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.75 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284329  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1330  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.38 
 
 		 117 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1243  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.38 
 
 		 117 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  43.75 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.838844 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 273 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3449  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.74 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3842  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.51 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656555  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  34.38 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0964  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.25 
 
 		 121 aa  40  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.179543  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>