107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0183 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  100 
 
 
91 aa  192  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4246  protein of unknown function DUF861 cupin_3  60.23 
 
 
97 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4308  protein of unknown function DUF861 cupin_3  60.23 
 
 
97 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0121771  normal  0.0723845 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0659  hypothetical protein  61.11 
 
 
91 aa  120  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.42337  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  60.67 
 
 
91 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0714  protein of unknown function DUF861, cupin_3  54.35 
 
 
109 aa  115  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.729837  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1616  hypothetical protein  58.43 
 
 
90 aa  115  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0651  hypothetical protein  57.3 
 
 
90 aa  114  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1386  cupin superfamily protein  58.62 
 
 
91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.101999  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0779  protein of unknown function DUF861 cupin_3  56.82 
 
 
91 aa  110  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0364385  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0959  cupin superfamily protein  62.82 
 
 
91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10461  hypothetical protein  57.47 
 
 
90 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1533  protein of unknown function DUF861, cupin_3  50.56 
 
 
91 aa  104  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000391778  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9903  predicted protein  63.38 
 
 
71 aa  103  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0288299  normal  0.909152 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1097  hypothetical protein  50.55 
 
 
92 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.714468  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1704  protein of unknown function DUF861 cupin_3  53.41 
 
 
89 aa  101  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1631  protein of unknown function DUF861, cupin_3  54.88 
 
 
87 aa  98.6  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11190  predicted enzyme of the cupin superfamily  55.56 
 
 
90 aa  97.8  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1469  hypothetical protein  52.7 
 
 
91 aa  97.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.278748  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15781  hypothetical protein  51.35 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15631  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  90.9  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1414  protein of unknown function DUF861, cupin_3  51.81 
 
 
89 aa  83.6  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000022631  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0997  protein of unknown function DUF861 cupin_3  52.94 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2357  hypothetical protein  41.77 
 
 
609 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1624  hypothetical protein  46.03 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0624  hypothetical protein  46.03 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.819765  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0842  hypothetical protein  46.77 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1145  hypothetical protein  46.03 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.212798  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1060  hypothetical protein  46.77 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1808  hypothetical protein  46.03 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  42.11 
 
 
114 aa  63.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4665  hypothetical protein  37.65 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777876  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0453  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.65 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0932  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.65 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4529  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.65 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241247  normal  0.339292 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.65 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0807  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.47 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4028  hypothetical protein  37.65 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0796  protein of unknown function DUF861, cupin_3  38.16 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4660  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.47 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.894659  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0771  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.47 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356795  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28380  hypothetical protein  32.58 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2474  hypothetical protein  34.12 
 
 
114 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3163  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.71 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230079  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  41.27 
 
 
117 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0697  hypothetical protein  32.22 
 
 
114 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.895833  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.07 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  0.0542414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5064  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.07 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1806  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.71 
 
 
150 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4595  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.98 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0443354 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0990  hypothetical protein  36.76 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.154522 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0904  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.92 
 
 
113 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7582  normal  0.40632 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1093  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.29 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5486  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.24 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.72 
 
 
123 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4304  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.92 
 
 
113 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.631594  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.72 
 
 
123 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0874  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0771767  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.72 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4332  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.98 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0236  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.14 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5081  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.29 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.7 
 
 
170 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6090  hypothetical protein  36.51 
 
 
120 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0918  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.33 
 
 
113 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0754701  normal  0.435909 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1112  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.92 
 
 
120 aa  47.4  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143177  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5279  hypothetical protein  34.38 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0091  hypothetical protein  34.29 
 
 
121 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  34.92 
 
 
114 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  34.92 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.5 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3024  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.51 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00331954  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70170  hypothetical protein  34.92 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5189  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.38 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  0.130139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  34.92 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.92 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5331  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.38 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.038012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0191  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.38 
 
 
119 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5535  hypothetical protein  34.92 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110951  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1243  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.1 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0909  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.81 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2651  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000014442  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0964  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.75 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.179543  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0226  hypothetical protein  31.43 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0047  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.33 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0360  hypothetical protein  36.07 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2676  hypothetical protein  32.81 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0142789 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3449  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.33 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3108  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.33 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312601  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1330  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.51 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335699  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5674  hypothetical protein  39.22 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0614  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.79 
 
 
116 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1428  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.95 
 
 
127 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3632  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.43 
 
 
167 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6639  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.25 
 
 
120 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  41.67 
 
 
117 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.838844 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  31.08 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6071  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.08 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.33 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.33 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>