107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1386 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1386  cupin superfamily protein  100 
 
 
91 aa  190  7e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.101999  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0959  cupin superfamily protein  83.52 
 
 
91 aa  163  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10461  hypothetical protein  74.44 
 
 
90 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0659  hypothetical protein  59.55 
 
 
91 aa  121  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.42337  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15781  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  113  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  58.62 
 
 
91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1469  hypothetical protein  48.35 
 
 
91 aa  110  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.278748  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15631  hypothetical protein  47.25 
 
 
91 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4308  protein of unknown function DUF861 cupin_3  59.21 
 
 
97 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0121771  normal  0.0723845 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4246  protein of unknown function DUF861 cupin_3  59.21 
 
 
97 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0779  protein of unknown function DUF861 cupin_3  50.55 
 
 
91 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0364385  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  50 
 
 
91 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11190  predicted enzyme of the cupin superfamily  53.93 
 
 
90 aa  103  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0651  hypothetical protein  48.89 
 
 
90 aa  97.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1704  protein of unknown function DUF861 cupin_3  48.31 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1616  hypothetical protein  46.07 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1631  protein of unknown function DUF861, cupin_3  47.13 
 
 
87 aa  91.7  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1533  protein of unknown function DUF861, cupin_3  46.07 
 
 
91 aa  91.3  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000391778  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0714  protein of unknown function DUF861, cupin_3  43.96 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.729837  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1414  protein of unknown function DUF861, cupin_3  49.44 
 
 
89 aa  88.6  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000022631  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1097  hypothetical protein  43.18 
 
 
92 aa  87.8  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.714468  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9903  predicted protein  52.11 
 
 
71 aa  85.5  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0288299  normal  0.909152 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0997  protein of unknown function DUF861 cupin_3  47.89 
 
 
88 aa  76.3  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2357  hypothetical protein  42.86 
 
 
609 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0990  hypothetical protein  38.24 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.154522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  42.65 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1093  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.76 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5081  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.76 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0624  hypothetical protein  42.86 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.819765  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1624  hypothetical protein  42.86 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0842  hypothetical protein  42.86 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1145  hypothetical protein  42.86 
 
 
174 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.212798  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1060  hypothetical protein  42.86 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1808  hypothetical protein  42.86 
 
 
174 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0796  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.18 
 
 
114 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4028  hypothetical protein  35.62 
 
 
114 aa  52.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  37.5 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0807  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.62 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.99 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.71 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  0.0542414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5064  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.71 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  35.94 
 
 
115 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  35.94 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.5 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4665  hypothetical protein  35.62 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777876  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4529  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.62 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241247  normal  0.339292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0918  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.94 
 
 
113 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0754701  normal  0.435909 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0904  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.94 
 
 
113 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7582  normal  0.40632 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0453  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.25 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0932  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.25 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4660  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.25 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.894659  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0771  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.25 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356795  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.25 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.5 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4304  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.38 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.631594  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4595  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.32 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0443354 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0874  hypothetical protein  34.38 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0771767  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0047  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.81 
 
 
119 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4332  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.71 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28380  hypothetical protein  32.88 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2474  hypothetical protein  32.88 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3108  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.38 
 
 
119 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312601  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3163  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.33 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230079  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.71 
 
 
170 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.85 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3501  hypothetical protein  34.38 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0697  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.895833  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.38 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.38 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1090  hypothetical protein  34.38 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00838125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1150  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.38 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00929773  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1184  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.38 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.831048  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.85 
 
 
123 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.85 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3205  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.38 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0360  hypothetical protein  37.1 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0042  hypothetical protein  31.82 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5486  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.35 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1516  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.81 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1806  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.48 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1082  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.81 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000597126  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.92 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3024  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.33 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00331954  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2676  hypothetical protein  32.31 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0142789 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4007  hypothetical protein  31.82 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1428  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.51 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3632  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.48 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3842  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.5 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656555  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1483  hypothetical protein  31.25 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171215  hitchhiker  0.000969806 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1042  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.49 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284329  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1243  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.81 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0745  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.35 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3784  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.38 
 
 
222 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0614  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.26 
 
 
116 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0909  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.03 
 
 
116 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2491  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.38 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415528  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  34.38 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3449  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.25 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2651  hypothetical protein  32.81 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000014442  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0964  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.81 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.179543  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>