94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1704 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1704  protein of unknown function DUF861 cupin_3  100 
 
 
89 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1631  protein of unknown function DUF861, cupin_3  96.55 
 
 
87 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11190  predicted enzyme of the cupin superfamily  60.47 
 
 
90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1414  protein of unknown function DUF861, cupin_3  67.05 
 
 
89 aa  111  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000022631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  54.55 
 
 
91 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1616  hypothetical protein  58.62 
 
 
90 aa  104  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1097  hypothetical protein  56.79 
 
 
92 aa  103  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.714468  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0651  hypothetical protein  56.18 
 
 
90 aa  103  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  53.41 
 
 
91 aa  101  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0659  hypothetical protein  55.68 
 
 
91 aa  100  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.42337  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4246  protein of unknown function DUF861 cupin_3  54.02 
 
 
97 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4308  protein of unknown function DUF861 cupin_3  54.02 
 
 
97 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0121771  normal  0.0723845 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0714  protein of unknown function DUF861, cupin_3  53.57 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.729837  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0779  protein of unknown function DUF861 cupin_3  52.94 
 
 
91 aa  97.1  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0364385  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1386  cupin superfamily protein  48.31 
 
 
91 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.101999  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15781  hypothetical protein  44.94 
 
 
91 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1533  protein of unknown function DUF861, cupin_3  54.32 
 
 
91 aa  90.9  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000391778  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1469  hypothetical protein  43.82 
 
 
91 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.278748  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15631  hypothetical protein  44.94 
 
 
91 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10461  hypothetical protein  46.07 
 
 
90 aa  86.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0959  cupin superfamily protein  43.82 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0997  protein of unknown function DUF861 cupin_3  45.35 
 
 
88 aa  78.6  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9903  predicted protein  46.38 
 
 
71 aa  76.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0288299  normal  0.909152 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4332  protein of unknown function DUF861 cupin_3  41.94 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2357  hypothetical protein  34.92 
 
 
609 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1145  hypothetical protein  34.85 
 
 
174 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.212798  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1808  hypothetical protein  34.85 
 
 
174 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0624  hypothetical protein  34.85 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.819765  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0842  hypothetical protein  34.85 
 
 
123 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1060  hypothetical protein  34.85 
 
 
123 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4595  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.32 
 
 
163 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0443354 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.91 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1624  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.84 
 
 
117 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5279  hypothetical protein  35.82 
 
 
119 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0964  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.33 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.179543  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5189  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.33 
 
 
119 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  0.130139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5331  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.33 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.038012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0191  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.33 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3449  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.33 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3108  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.82 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312601  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0360  hypothetical protein  35.48 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2618  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.91 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.813991  normal  0.532352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5486  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.4 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.82 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.82 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5064  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.65 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.65 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  0.0542414 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1093  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.29 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.3 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0990  hypothetical protein  36.76 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.154522 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.3 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.3 
 
 
123 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.34 
 
 
128 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  35.85 
 
 
119 aa  47  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3174  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.71 
 
 
93 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00906812  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  37.5 
 
 
126 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0236  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.33 
 
 
119 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3632  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.71 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3501  hypothetical protein  34.33 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3205  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.82 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1090  hypothetical protein  35.82 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00838125  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1184  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.82 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.831048  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1082  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.82 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000597126  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1150  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.82 
 
 
121 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2651  hypothetical protein  31.34 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000014442  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5081  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.82 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3509  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.14 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5535  hypothetical protein  32.84 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110951  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6090  hypothetical protein  32.84 
 
 
120 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1058  Ethanolamine utilisation EutQ family protein  32.84 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1806  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.33 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70170  hypothetical protein  31.34 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.82 
 
 
120 aa  43.5  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3024  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.34 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00331954  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0909  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.62 
 
 
116 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7526  hypothetical protein  32.05 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190702  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1428  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.43 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6071  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.94 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6639  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.75 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1112  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.85 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143177  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  45.1 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.919827  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.29 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  28.99 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0091  hypothetical protein  29.85 
 
 
121 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0226  hypothetical protein  29.85 
 
 
122 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  45.1 
 
 
117 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.838844 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6271  hypothetical protein  32.86 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3083  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.36 
 
 
296 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2491  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.38 
 
 
115 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415528  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0868  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.94 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470118  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3842  protein of unknown function DUF861 cupin_3  44.9 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656555  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1042  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.73 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284329  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0903  ethanolamine utilization protein EutQ  29.69 
 
 
157 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0205632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>