60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1097 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1097  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  193  7e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.714468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  52.27 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0659  hypothetical protein  56.18 
 
 		 91 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.42337  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0779  protein of unknown function DUF861 cupin_3  57.83 
 
 		 91 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0364385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1704  protein of unknown function DUF861 cupin_3  56.79 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1631  protein of unknown function DUF861, cupin_3  55.56 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  50.55 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0714  protein of unknown function DUF861, cupin_3  50.56 
 
 		 109 aa  100  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.729837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10461  hypothetical protein  48.89 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11190  predicted enzyme of the cupin superfamily  53.66 
 
 		 90 aa  98.6  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4246  protein of unknown function DUF861 cupin_3  50.57 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1616  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4308  protein of unknown function DUF861 cupin_3  50.57 
 
 		 97 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0121771  normal  0.0723845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0651  hypothetical protein  48.86 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15781  hypothetical protein  45.45 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1414  protein of unknown function DUF861, cupin_3  54.32 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000022631  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1533  protein of unknown function DUF861, cupin_3  47.78 
 
 		 91 aa  92  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000391778  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1469  hypothetical protein  44.32 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.278748  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15631  hypothetical protein  44.32 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1386  cupin superfamily protein  43.18 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.101999  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0959  cupin superfamily protein  42.22 
 
 		 91 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9903  predicted protein  49.3 
 
 		 71 aa  79.7  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0288299  normal  0.909152 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0997  protein of unknown function DUF861 cupin_3  43.9 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3174  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.46 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00906812  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.67 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4332  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.1 
 
 		 162 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1093  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.72 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4595  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.48 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0443354 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0360  hypothetical protein  35.48 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3449  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.5 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3632  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.82 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0990  hypothetical protein  35.48 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.154522 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.77 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5081  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.48 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1624  hypothetical protein  31.75 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2357  hypothetical protein  30.88 
 
 		 609 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.31 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  42.31 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5064  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.03 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.03 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  0.0542414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.31 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0624  hypothetical protein  30.16 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.819765  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0868  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.5 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470118  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1060  hypothetical protein  30.16 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0842  hypothetical protein  30.16 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1806  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.39 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1145  hypothetical protein  30.16 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.212798  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1808  hypothetical protein  30.16 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3096  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.73 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966058  normal  0.459198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.77 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5486  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.65 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.57 
 
 		 114 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4665  hypothetical protein  27.27 
 
 		 114 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777876  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4529  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27.27 
 
 		 114 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241247  normal  0.339292 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3784  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.86 
 
 		 222 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5279  hypothetical protein  27.27 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0771  protein of unknown function DUF861 cupin_3  25.97 
 
 		 114 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356795  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4660  protein of unknown function DUF861 cupin_3  25.97 
 
 		 114 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.894659  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4606  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.33 
 
 		 124 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>