77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0360 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0360  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  336  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4332  protein of unknown function DUF861 cupin_3  61.25 
 
 		 162 aa  208  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4595  protein of unknown function DUF861 cupin_3  58.64 
 
 		 163 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0443354 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  55.56 
 
 		 170 aa  186  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1624  hypothetical protein  43.51 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1808  hypothetical protein  44.27 
 
 		 174 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1145  hypothetical protein  44.27 
 
 		 174 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.212798  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0624  hypothetical protein  44.27 
 
 		 138 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.819765  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2357  hypothetical protein  48.62 
 
 		 609 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0842  hypothetical protein  44.72 
 
 		 123 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1060  hypothetical protein  44.72 
 
 		 123 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1093  protein of unknown function DUF861, cupin_3  39.23 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0990  hypothetical protein  39.23 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.154522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5081  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.46 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1806  protein of unknown function DUF861 cupin_3  42.37 
 
 		 150 aa  104  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5486  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.2 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.71 
 
 		 144 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  0.0542414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5064  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.71 
 
 		 149 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3632  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.79 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6071  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.33 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.42 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  34.83 
 
 		 126 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.58 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  30.43 
 
 		 115 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  32.65 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1097  hypothetical protein  35.48 
 
 		 92 aa  50.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.714468  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1631  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.48 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1704  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.48 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3842  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.1 
 
 		 91 aa  48.5  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1940  protein of the cupin superfamily-like protein  28.97 
 
 		 131 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  30.12 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0091  hypothetical protein  28.18 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0236  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27.93 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0659  hypothetical protein  39.34 
 
 		 91 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.42337  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15781  hypothetical protein  29.03 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10461  hypothetical protein  33.87 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.53 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6271  hypothetical protein  33.82 
 
 		 115 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.99 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1386  cupin superfamily protein  37.1 
 
 		 91 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.101999  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.55 
 
 		 128 aa  45.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0964  protein of unknown function DUF861, cupin_3  26.09 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.179543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1469  hypothetical protein  29.03 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.278748  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.99 
 
 		 120 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0226  hypothetical protein  28.89 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2676  hypothetical protein  32.35 
 
 		 114 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3509  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.8 
 
 		 121 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114973  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15631  hypothetical protein  27.42 
 
 		 91 aa  44.3  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1516  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.41 
 
 		 123 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0697  hypothetical protein  37.93 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.895833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3163  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.93 
 
 		 115 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230079  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3501  hypothetical protein  24.21 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7526  hypothetical protein  28.18 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190702  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.07 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9903  predicted protein  36.51 
 
 		 71 aa  43.9  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0288299  normal  0.909152 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1082  protein of unknown function DUF861, cupin_3  23.44 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000597126  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5714  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.78 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0614  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27.27 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7505  hypothetical protein  33.7 
 
 		 117 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  20.31 
 
 		 121 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3784  protein of unknown function DUF861, cupin_3  25.37 
 
 		 222 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  20.31 
 
 		 121 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3024  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27.78 
 
 		 124 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00331954  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70170  hypothetical protein  24.73 
 
 		 120 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5331  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.89 
 
 		 119 aa  42  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6090  hypothetical protein  23.66 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5189  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.89 
 
 		 119 aa  42  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  0.130139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3303  putative cytoplasmic protein  27.5 
 
 		 124 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3298  putative cytoplasmic protein  27.5 
 
 		 124 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.571522  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3472  hypothetical protein  27.5 
 
 		 124 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3370  hypothetical protein  27.5 
 
 		 124 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.587978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3377  putative cytoplasmic protein  27.5 
 
 		 124 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.627866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3108  protein of unknown function DUF861, cupin_3  22 
 
 		 119 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0621  protein of unknown function DUF861, cupin_3  25.71 
 
 		 130 aa  40.8  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0959  cupin superfamily protein  33.87 
 
 		 91 aa  40.8  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2651  hypothetical protein  27.91 
 
 		 121 aa  40.4  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000014442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>