62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0766 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0766  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  236  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.877225  normal  0.182245 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6100  protein of unknown function DUF861 cupin_3  71.93 
 
 		 114 aa  179  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  0.927165 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6574  protein of unknown function DUF861 cupin_3  72.81 
 
 		 114 aa  179  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.647379 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1483  hypothetical protein  71.93 
 
 		 114 aa  178  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171215  hitchhiker  0.000969806 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0047  protein of unknown function DUF861, cupin_3  44.35 
 
 		 119 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  45.71 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  44.76 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4304  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.47 
 
 		 113 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.631594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0918  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.47 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0754701  normal  0.435909 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0904  protein of unknown function DUF861, cupin_3  39.47 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7582  normal  0.40632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0874  hypothetical protein  38.6 
 
 		 113 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0771767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2676  hypothetical protein  35.65 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142789 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6271  hypothetical protein  33.91 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  47.83 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0290  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.91 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4028  hypothetical protein  31.82 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0807  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.68 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0796  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.68 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.82 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3163  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.88 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230079  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0932  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.82 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0453  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.82 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28380  hypothetical protein  34.85 
 
 		 114 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0697  hypothetical protein  37.88 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.895833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.39 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2474  hypothetical protein  34.85 
 
 		 114 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0771  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.68 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356795  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4660  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.68 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.894659  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4529  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.68 
 
 		 114 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241247  normal  0.339292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4665  hypothetical protein  30.68 
 
 		 114 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777876  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.68 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.99 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.838844 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3842  protein of unknown function DUF861 cupin_3  26.13 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656555  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3784  protein of unknown function DUF861, cupin_3  25.93 
 
 		 222 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5674  hypothetical protein  35.23 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0868  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470118  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.62 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.919827  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.88 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2907  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.5 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10461  hypothetical protein  31.25 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4966  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.8 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0418481 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.79 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1330  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.88 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1112  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.59 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.59 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1243  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.88 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2491  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.34 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415528  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1042  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.55 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284329  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1693  hypothetical protein  30.67 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7505  hypothetical protein  36.11 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5000  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.72 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0226  hypothetical protein  27.27 
 
 		 122 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2742  hypothetical protein  31.88 
 
 		 119 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.88 
 
 		 119 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0964  protein of unknown function DUF861, cupin_3  23.86 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.179543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.88 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0959  cupin superfamily protein  28.12 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3449  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.85 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2618  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.58 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.813991  normal  0.532352 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.41 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4423  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.68 
 
 		 118 aa  40  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1386  cupin superfamily protein  26.56 
 
 		 91 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.101999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>