30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3370 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3370  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  254  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.587978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3377  putative cytoplasmic protein  99.19 
 
 		 124 aa  253  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.627866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3472  hypothetical protein  98.39 
 
 		 124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3298  putative cytoplasmic protein  97.58 
 
 		 124 aa  250  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.571522  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3303  putative cytoplasmic protein  97.56 
 
 		 124 aa  248  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0614  protein of unknown function DUF861 cupin_3  55 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3509  protein of unknown function DUF861 cupin_3  44.44 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114973  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2942  hypothetical protein  43.1 
 
 		 121 aa  87  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34670  cupin superfamily protein  44.95 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180426  normal  0.0825937 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1755  hypothetical protein  34.67 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0401  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.67 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  33.73 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7505  hypothetical protein  36.25 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.17 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5081  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.21 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3501  hypothetical protein  26.6 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1112  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.21 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  27.17 
 
 		 119 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1082  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.55 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000597126  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1184  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.55 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.831048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1090  hypothetical protein  29.55 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00838125  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1093  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.21 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3205  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.55 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0360  hypothetical protein  27.5 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.91 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1533  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.86 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000391778  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0990  hypothetical protein  26.92 
 
 		 151 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.154522 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3163  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.13 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230079  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  25.53 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  25.53 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>