26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0614 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0614  protein of unknown function DUF861 cupin_3  100 
 
 
121 aa  250  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3370  hypothetical protein  55 
 
 
124 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.587978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3377  putative cytoplasmic protein  55 
 
 
124 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.627866  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3472  hypothetical protein  55 
 
 
124 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3298  putative cytoplasmic protein  54.17 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.571522  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3303  putative cytoplasmic protein  54.17 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3509  protein of unknown function DUF861 cupin_3  49.54 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114973  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34670  cupin superfamily protein  52.29 
 
 
121 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180426  normal  0.0825937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2942  hypothetical protein  51.38 
 
 
121 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1112  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.16 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143177  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.8 
 
 
128 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1755  hypothetical protein  34.07 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0401  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.07 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1184  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.4 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.831048  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1150  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.4 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00929773  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1090  hypothetical protein  28.4 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00838125  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3205  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.4 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  28.4 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7526  hypothetical protein  31.58 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190702  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1042  protein of unknown function DUF861, cupin_3  25.93 
 
 
127 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284329  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6071  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27.16 
 
 
126 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1516  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.43 
 
 
123 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3501  hypothetical protein  26.83 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6100  protein of unknown function DUF861 cupin_3  25.74 
 
 
114 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  0.927165 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3108  protein of unknown function DUF861, cupin_3  26.25 
 
 
119 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312601  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0909  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.75 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>