14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3509 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3509  protein of unknown function DUF861 cupin_3  100 
 
 		 121 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114973  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34670  cupin superfamily protein  73.55 
 
 		 121 aa  187  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180426  normal  0.0825937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2942  hypothetical protein  71.9 
 
 		 121 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0614  protein of unknown function DUF861 cupin_3  49.54 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3377  putative cytoplasmic protein  44.44 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.627866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3370  hypothetical protein  44.44 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.587978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3298  putative cytoplasmic protein  44.44 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.571522  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3472  hypothetical protein  44.44 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3303  putative cytoplasmic protein  44.44 
 
 		 124 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  29.59 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0360  hypothetical protein  35.8 
 
 		 163 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1093  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.53 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0990  hypothetical protein  29.63 
 
 		 151 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.154522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5081  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.33 
 
 		 151 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>