More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0608 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0608  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 269 aa  532  1e-150  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.912503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0607  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 248 aa  182  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  34.23 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.86 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  41.98 
 
 		 230 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1848  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.17 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0065624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1342  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.7 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0144629  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  43.14 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.26 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.14 
 
 		 234 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 231 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.14 
 
 		 234 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0673  two component transcriptional regulator, winged helix family  29 
 
 		 235 aa  108  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.996485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1334  two component transcriptional regulator  31.58 
 
 		 243 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 230 aa  108  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 237 aa  108  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  29.78 
 
 		 231 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.27 
 
 		 221 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3413  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.47 
 
 		 236 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  34.04 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0819  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.17 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2990  two component transcriptional regulator  38.82 
 
 		 230 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  35.06 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03101  two-component response regulator transcription regulator protein  40.79 
 
 		 226 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0528  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.53 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  33.48 
 
 		 256 aa  105  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2788  two component transcriptional regulator  35.09 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471427  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1879  DNA-binding response regulator  31.14 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000557668  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  39.38 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1399  two component transcriptional regulator  30.94 
 
 		 239 aa  105  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3225  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.16 
 
 		 231 aa  105  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1948  response regulator receiver domain-containing protein  31.42 
 
 		 226 aa  105  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.74 
 
 		 240 aa  105  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6533  cell cycle transcriptional regulator CtrA  29.91 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.62 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2490  heavy metal response regulator  34.22 
 
 		 228 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.76 
 
 		 225 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5448  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.74 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.270851  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  32.16 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3569  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.26 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0818  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.37 
 
 		 236 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.501115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2306  two component transcriptional regulator  37.09 
 
 		 225 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3912  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  30.4 
 
 		 223 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4233  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0736222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0237  two component transcriptional regulator  35.06 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3672  winged helix family two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  33.78 
 
 		 222 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3904  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.28 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1822  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.91 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.077619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  31.78 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03140  two component response regulator transcription regulator protein  32.3 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249511  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  30.26 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0525  transcriptional regulatory protein  29.91 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369528  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1138  two component transcriptional regulator  33.77 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  36.05 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2550  two component transcriptional regulator  37.75 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605198 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2799  two component transcriptional regulator  33.77 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3615  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2213  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  27.47 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2599  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.25 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  31.3 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  29.82 
 
 		 223 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.78 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  31.53 
 
 		 224 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3371  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 233 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.442318  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5598  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  29.82 
 
 		 223 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5962  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0352079 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08510  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.8 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103906  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1291  two component transcriptional regulator  29.69 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000572556  hitchhiker  0.0000375019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.49 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0705  two component heavy metal response transcriptional regulator  27.8 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.74 
 
 		 229 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.64 
 
 		 226 aa  102  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1903  two component transcriptional regulator  30.04 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46550  response regulator  35.65 
 
 		 267 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203573  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3622  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.03 
 
 		 233 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0114155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  35.53 
 
 		 223 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2621  two component transcriptional regulator  30.04 
 
 		 237 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.75303  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1279  two component transcriptional regulator  30.04 
 
 		 237 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.461363  normal  0.257738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3946  two component transcriptional regulator  27.03 
 
 		 233 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.26309  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.3 
 
 		 224 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1104  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.8 
 
 		 233 aa  102  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  29.82 
 
 		 223 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3488  two component transcriptional regulator  27.03 
 
 		 233 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.487721  normal  0.120653 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2924  two component transcriptional regulator  32.3 
 
 		 234 aa  102  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.470238 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  29.82 
 
 		 223 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0747  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.03 
 
 		 233 aa  102  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  0.934966 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  32.89 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  29.82 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2350  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.78 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.275786  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  30.91 
 
 		 229 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  31 
 
 		 225 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>