More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0190 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0190  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
431 aa  874    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1714  Histidinol dehydrogenase  41.96 
 
 
432 aa  322  9.000000000000001e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000013465  hitchhiker  0.000000000040894 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  40.55 
 
 
434 aa  310  4e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  41.34 
 
 
430 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  42.86 
 
 
422 aa  306  6e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  42.14 
 
 
436 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  42.57 
 
 
430 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  42.13 
 
 
425 aa  301  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  41.63 
 
 
432 aa  299  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  41.67 
 
 
424 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  39.26 
 
 
434 aa  294  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  39.71 
 
 
429 aa  293  5e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  40.37 
 
 
434 aa  292  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  39.35 
 
 
454 aa  292  8e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  40.7 
 
 
432 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  40.47 
 
 
432 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  39.36 
 
 
429 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  38.05 
 
 
433 aa  291  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  41.81 
 
 
431 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  36.51 
 
 
437 aa  290  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  40.41 
 
 
432 aa  290  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  36.41 
 
 
428 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  38.86 
 
 
429 aa  289  6e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  40.98 
 
 
431 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  39.22 
 
 
429 aa  288  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  35.19 
 
 
424 aa  287  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  39.22 
 
 
429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  38.97 
 
 
429 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  38.48 
 
 
429 aa  286  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  41.34 
 
 
438 aa  286  5e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  37.18 
 
 
432 aa  286  5e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  40.45 
 
 
436 aa  286  5.999999999999999e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16681  histidinol dehydrogenase  37.35 
 
 
428 aa  286  7e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  38.73 
 
 
429 aa  286  7e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  38.97 
 
 
429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  38.97 
 
 
429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  38.97 
 
 
429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  39.25 
 
 
440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  38.24 
 
 
429 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  38.46 
 
 
434 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  39.27 
 
 
427 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  41.83 
 
 
431 aa  283  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  41.77 
 
 
441 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  35.89 
 
 
428 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  40.51 
 
 
445 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  38.8 
 
 
432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  40.99 
 
 
433 aa  283  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  40.29 
 
 
439 aa  282  8.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  37.32 
 
 
427 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  39.81 
 
 
435 aa  282  9e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  41.21 
 
 
434 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  35.47 
 
 
449 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1819  histidinol dehydrogenase  35.56 
 
 
430 aa  282  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  35.47 
 
 
449 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  39.1 
 
 
442 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  39.85 
 
 
446 aa  281  2e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  39.51 
 
 
457 aa  281  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  37.87 
 
 
426 aa  279  5e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1478  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 
431 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  38.75 
 
 
431 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1581  histidinol dehydrogenase  36.43 
 
 
440 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  38.88 
 
 
431 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  40.45 
 
 
435 aa  277  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  39.67 
 
 
439 aa  277  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  35.15 
 
 
428 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  39.9 
 
 
435 aa  276  5e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  41.87 
 
 
434 aa  276  5e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  35.38 
 
 
430 aa  276  6e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  35.58 
 
 
428 aa  275  8e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  40.39 
 
 
431 aa  275  9e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  37.64 
 
 
429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  39.01 
 
 
427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  37.78 
 
 
436 aa  273  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  39.21 
 
 
438 aa  273  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  38.85 
 
 
433 aa  274  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  39.95 
 
 
434 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  40.43 
 
 
431 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  39.95 
 
 
434 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16101  histidinol dehydrogenase  36.09 
 
 
423 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  39.34 
 
 
430 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  40.43 
 
 
431 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  38.96 
 
 
436 aa  273  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  39.01 
 
 
430 aa  272  8.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  38.94 
 
 
427 aa  272  9e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1216  histidinol dehydrogenase  36.05 
 
 
428 aa  271  1e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.755832  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0584  histidinol dehydrogenase  40.69 
 
 
497 aa  271  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.140343  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  41.6 
 
 
434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  39.52 
 
 
431 aa  270  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  37.18 
 
 
436 aa  270  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  38.42 
 
 
436 aa  270  5e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1939  Histidinol dehydrogenase  40.1 
 
 
431 aa  270  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0835153 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  38.82 
 
 
430 aa  269  7e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  37.12 
 
 
439 aa  269  8.999999999999999e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  38.82 
 
 
430 aa  268  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  38.16 
 
 
430 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  40.74 
 
 
424 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  37.93 
 
 
439 aa  268  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  36.72 
 
 
429 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2026  histidinol dehydrogenase  38.19 
 
 
430 aa  268  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  37.78 
 
 
441 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>