More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_31440 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009358  OSTLU_31440  predicted protein  100 
 
 
474 aa  976    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04070  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, putative  28.36 
 
 
654 aa  131  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.434844  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04736  DNA lyase Apn2 (AFU_orthologue; AFUA_3G06180)  29.13 
 
 
612 aa  110  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.847372  normal  0.290859 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  29.74 
 
 
251 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  30.6 
 
 
264 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47361  predicted protein  28.1 
 
 
489 aa  93.2  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  34.04 
 
 
254 aa  91.7  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.74 
 
 
258 aa  90.9  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.03 
 
 
259 aa  90.5  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  32.34 
 
 
253 aa  90.5  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  32.34 
 
 
255 aa  90.5  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  30.22 
 
 
254 aa  90.1  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  29.2 
 
 
259 aa  90.1  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  28.41 
 
 
262 aa  89.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  30.11 
 
 
256 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  28.47 
 
 
250 aa  88.2  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  27 
 
 
257 aa  85.5  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  27.24 
 
 
255 aa  85.9  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  29.43 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  28.15 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  28.88 
 
 
247 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  28.31 
 
 
259 aa  83.2  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  27.08 
 
 
253 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  29.43 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  26.52 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  25.8 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  25.27 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  26.81 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6423  exodeoxyribonuclease III Xth  29.64 
 
 
301 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  29.37 
 
 
257 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  28.07 
 
 
255 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  29.82 
 
 
262 aa  79.7  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  31.07 
 
 
252 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  27.3 
 
 
253 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  25.71 
 
 
250 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  26.18 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  26.95 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  27.07 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  28.12 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  26.04 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  27.47 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  27.5 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  32.2 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  27.74 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  26.57 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  29.56 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  26.57 
 
 
257 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3929  exodeoxyribonuclease III  28.06 
 
 
263 aa  75.5  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  25.19 
 
 
252 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2513  exodeoxyribonuclease III Xth  29.7 
 
 
256 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120216  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  28.68 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0288  exodeoxyribonuclease III Xth  28.47 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.36 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  25.09 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  25.09 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  25.09 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  26.06 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0277  exodeoxyribonuclease III Xth  28.21 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  24.81 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  26.42 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0295  exodeoxyribonuclease III Xth  27.05 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  24.72 
 
 
252 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0146  exodeoxyribonuclease III Xth  34.66 
 
 
258 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00325986  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  25.87 
 
 
257 aa  72.4  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0121  exodeoxyribonuclease III Xth  26.35 
 
 
266 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00155792  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6475  exodeoxyribonuclease III Xth  28.52 
 
 
264 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  27.31 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  27.24 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5745  exodeoxyribonuclease III Xth  26.87 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  24.72 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0138  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.22 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.287048  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0233  exodeoxyribonuclease III Xth  28.99 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0140  putative exodeoxyribonuclease III protein  26.3 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0042  exodeoxyribonuclease III Xth  26.92 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.169682 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0036  exodeoxyribonuclease III Xth  26.92 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1528  exonuclease III  28.36 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  29.78 
 
 
251 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  30.05 
 
 
248 aa  69.3  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  25.98 
 
 
260 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  25.98 
 
 
260 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0227  exodeoxyribonuclease III Xth  28.99 
 
 
267 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  26.52 
 
 
255 aa  69.7  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28317  AP endonuclease  23.36 
 
 
482 aa  69.7  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.563607 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  27.31 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  27.21 
 
 
254 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  25.09 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  24.35 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0113  AP endonuclease  28.3 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0350  exodeoxyribonuclease III Xth  31.05 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0362795  normal  0.625114 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0157  exodeoxyribonuclease III Xth  27.54 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00989742  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  26.02 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1725  exodeoxyribonuclease III Xth  25.19 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.569641  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  28.65 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  28.25 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  28.65 
 
 
252 aa  67  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  27.07 
 
 
254 aa  67  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  27.02 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1784  exodeoxyribonuclease III  25.18 
 
 
259 aa  66.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  28.09 
 
 
259 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  28.09 
 
 
259 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>