50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1391 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1391  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein  100 
 
 		 470 aa  937    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1722  C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex aNOP56 subunit  44.52 
 
 		 409 aa  259  6e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1468  C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex aNOP56 subunit  36.89 
 
 		 490 aa  251  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.665023  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0376  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  36.49 
 
 		 412 aa  247  3e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.599925  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1010  C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex aNOP56 subunit  37.82 
 
 		 480 aa  243  6e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1618  C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex aNOP56 subunit  41.39 
 
 		 485 aa  242  9e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0296  C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex aNOP56 subunit  41.14 
 
 		 484 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1915  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  46.58 
 
 		 411 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0760  C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex aNOP56 subunit  38.16 
 
 		 493 aa  209  6e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526132  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1284  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  43.59 
 
 		 402 aa  197  4.0000000000000005e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000448185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0805  rRNA biogenesis protein Nop56/Nop58  35.76 
 
 		 336 aa  194  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0402  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  39.94 
 
 		 420 aa  193  6e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.143885 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1726  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein  42.06 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0289991  hitchhiker  0.000329724 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1106  rRNA biogenesis protein Nop56/Nop58  38.4 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1378  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  45.53 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00034062  hitchhiker  0.0041241 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1562  rRNA biogenesis protein Nop56/Nop58  34.83 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.001188  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19552  predicted protein  37.79 
 
 		 529 aa  182  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00090  rRNA modification-related protein, putative  40.25 
 
 		 568 aa  177  3e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0365741  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03167  Nucleolar protein 58 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8G3]  39.61 
 
 		 586 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10352  pre-rRNA processing nucleolar protein Sik1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09600)  38.76 
 
 		 510 aa  176  7e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.92374 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30396  predicted protein  41.41 
 
 		 474 aa  176  9e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68812  nucleolar protein involved in pre- rRNA processing  38.37 
 
 		 499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.116382  normal  0.0643077 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50302  predicted protein  37.4 
 
 		 471 aa  171  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03320  small nuclear ribonucleoprotein, putative  38.68 
 
 		 584 aa  170  4e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72477  part of small (ribosomal) subunit (SSU) processosome; U3 snoRNP protein  42.04 
 
 		 515 aa  170  5e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18579  predicted protein  35.82 
 
 		 510 aa  160  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.445158  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0541  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  33.89 
 
 		 286 aa  152  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0672918  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1637  hypothetical protein  31.11 
 
 		 295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2745  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  29.71 
 
 		 287 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0516  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  32.73 
 
 		 289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2086  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  32.36 
 
 		 295 aa  126  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2237  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  31.29 
 
 		 279 aa  126  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.881727 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0831  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  32.87 
 
 		 285 aa  123  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0407  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  29.86 
 
 		 299 aa  123  8e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.033854  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0693  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  31.27 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.874569  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1041  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  29.45 
 
 		 287 aa  120  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05520  conserved hypothetical protein  29.49 
 
 		 553 aa  119  9e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00050956  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2265  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  29.67 
 
 		 295 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_94220  predicted protein  27.45 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0109  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  44.06 
 
 		 262 aa  103  8e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.380556  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43576  predicted protein  29.22 
 
 		 483 aa  87.8  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389982  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01260  pre-mRNA splicing factor (Prp31), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10190)  25.7 
 
 		 521 aa  87.8  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0917143 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46989  splicing factor  24.14 
 
 		 544 aa  74.7  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.192868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1891  PT repeat-containing protein  32.39 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.980004  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1767  putative autotransporter  42.86 
 
 		 1984 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.209421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2996  pseudouridine synthase, Rsu  56.04 
 
 		 621 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.772965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26220  predicted SAM-dependent methyltransferase  41.28 
 
 		 657 aa  46.6  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0399  type III restriction protein res subunit  57.89 
 
 		 1104 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303076 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4150  transcription termination factor Rho  40.21 
 
 		 747 aa  44.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6067  hypothetical protein  46.9 
 
 		 936 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>