43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1378 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1378  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  100 
 
 		 422 aa  841    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00034062  hitchhiker  0.0041241 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1726  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein  84.55 
 
 		 420 aa  628  1e-179  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0289991  hitchhiker  0.000329724 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0402  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  80.6 
 
 		 420 aa  610  1e-173  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.143885 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1106  rRNA biogenesis protein Nop56/Nop58  82.2 
 
 		 416 aa  598  1e-170  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1284  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  55.97 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000448185 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0376  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  50.51 
 
 		 412 aa  365  1e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.599925  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1722  C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex aNOP56 subunit  46.77 
 
 		 409 aa  332  6e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1915  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  48.03 
 
 		 411 aa  295  1e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1618  C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex aNOP56 subunit  42.91 
 
 		 485 aa  237  3e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0760  C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex aNOP56 subunit  41.12 
 
 		 493 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526132  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1010  C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex aNOP56 subunit  42.33 
 
 		 480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0296  C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex aNOP56 subunit  42.91 
 
 		 484 aa  234  3e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1468  C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex aNOP56 subunit  40.97 
 
 		 490 aa  231  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.665023  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50302  predicted protein  34.57 
 
 		 471 aa  209  9e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10352  pre-rRNA processing nucleolar protein Sik1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09600)  39.16 
 
 		 510 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.92374 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03320  small nuclear ribonucleoprotein, putative  40.68 
 
 		 584 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00090  rRNA modification-related protein, putative  36.03 
 
 		 568 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0365741  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03167  Nucleolar protein 58 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8G3]  35.94 
 
 		 586 aa  196  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1391  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein  43.58 
 
 		 470 aa  196  7e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68812  nucleolar protein involved in pre- rRNA processing  38.02 
 
 		 499 aa  195  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.116382  normal  0.0643077 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1562  rRNA biogenesis protein Nop56/Nop58  39.64 
 
 		 354 aa  193  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.001188  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19552  predicted protein  42.86 
 
 		 529 aa  189  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72477  part of small (ribosomal) subunit (SSU) processosome; U3 snoRNP protein  44.44 
 
 		 515 aa  185  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30396  predicted protein  41.2 
 
 		 474 aa  182  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18579  predicted protein  37.55 
 
 		 510 aa  179  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.445158  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0805  rRNA biogenesis protein Nop56/Nop58  38.49 
 
 		 336 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0541  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  33.33 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0672918  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2237  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  38.42 
 
 		 279 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.881727 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0516  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  32.58 
 
 		 289 aa  124  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0109  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  56.39 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.380556  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1637  hypothetical protein  31.72 
 
 		 295 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2086  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  34.02 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2745  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  31.45 
 
 		 287 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1041  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  32.41 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0407  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  30.97 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.033854  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0693  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  31.58 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.874569  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0831  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  34.33 
 
 		 285 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_94220  predicted protein  28.24 
 
 		 393 aa  96.3  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05520  conserved hypothetical protein  29.22 
 
 		 553 aa  94.4  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00050956  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2265  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  30.14 
 
 		 295 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43576  predicted protein  27.43 
 
 		 483 aa  78.2  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389982  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01260  pre-mRNA splicing factor (Prp31), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10190)  24.81 
 
 		 521 aa  77.4  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0917143 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46989  splicing factor  25.75 
 
 		 544 aa  68.2  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.192868  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>