42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_94220 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009358  OSTLU_94220  predicted protein  100 
 
 		 393 aa  806    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05520  conserved hypothetical protein  41.04 
 
 		 553 aa  296  5e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00050956  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01260  pre-mRNA splicing factor (Prp31), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10190)  33.25 
 
 		 521 aa  202  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0917143 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46989  splicing factor  33.44 
 
 		 544 aa  192  6e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.192868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43576  predicted protein  38.78 
 
 		 483 aa  171  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389982  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30396  predicted protein  28.46 
 
 		 474 aa  122  7e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00090  rRNA modification-related protein, putative  29.33 
 
 		 568 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0365741  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1468  C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex aNOP56 subunit  29.45 
 
 		 490 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.665023  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1618  C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex aNOP56 subunit  28.62 
 
 		 485 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0296  C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex aNOP56 subunit  28.01 
 
 		 484 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1010  C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex aNOP56 subunit  28.3 
 
 		 480 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03167  Nucleolar protein 58 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8G3]  30.43 
 
 		 586 aa  107  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0376  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  30.43 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.599925  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68812  nucleolar protein involved in pre- rRNA processing  24.43 
 
 		 499 aa  100  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.116382  normal  0.0643077 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10352  pre-rRNA processing nucleolar protein Sik1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09600)  25.38 
 
 		 510 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.92374 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1722  C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex aNOP56 subunit  26.79 
 
 		 409 aa  99  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18579  predicted protein  25.98 
 
 		 510 aa  98.6  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.445158  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19552  predicted protein  28 
 
 		 529 aa  96.3  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0760  C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex aNOP56 subunit  25.67 
 
 		 493 aa  95.1  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526132  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03320  small nuclear ribonucleoprotein, putative  25.39 
 
 		 584 aa  95.1  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72477  part of small (ribosomal) subunit (SSU) processosome; U3 snoRNP protein  28.48 
 
 		 515 aa  89  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50302  predicted protein  24.15 
 
 		 471 aa  89  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1391  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein  26.15 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1726  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein  29.49 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0289991  hitchhiker  0.000329724 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1106  rRNA biogenesis protein Nop56/Nop58  30.77 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1915  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  28.93 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1562  rRNA biogenesis protein Nop56/Nop58  28.74 
 
 		 354 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.001188  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0402  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  28.21 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.143885 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1378  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  29.49 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00034062  hitchhiker  0.0041241 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0805  rRNA biogenesis protein Nop56/Nop58  31.1 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0407  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  35.17 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.033854  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1284  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  27.56 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000448185 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2237  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  30.07 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.881727 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0693  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  29.24 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.874569  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2086  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  35.71 
 
 		 295 aa  67  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1041  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  35.59 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2745  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  33.61 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0541  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  32.28 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0672918  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0516  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  30.22 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0831  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  33.33 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1637  hypothetical protein  26.15 
 
 		 295 aa  57  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0109  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  32.5 
 
 		 262 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.380556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>