43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_10352 on replicon BN001306
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_10352  pre-rRNA processing nucleolar protein Sik1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09600)  100 
 
 
510 aa  1043    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.92374 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68812  nucleolar protein involved in pre- rRNA processing  67.35 
 
 
499 aa  609  1e-173  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.116382  normal  0.0643077 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03320  small nuclear ribonucleoprotein, putative  58.2 
 
 
584 aa  513  1e-144  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50302  predicted protein  60.37 
 
 
471 aa  510  1e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18579  predicted protein  54.52 
 
 
510 aa  457  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.445158  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30396  predicted protein  45.59 
 
 
474 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19552  predicted protein  43.25 
 
 
529 aa  336  5.999999999999999e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03167  Nucleolar protein 58 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8G3]  45.98 
 
 
586 aa  312  6.999999999999999e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00090  rRNA modification-related protein, putative  41.69 
 
 
568 aa  296  4e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0365741  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72477  part of small (ribosomal) subunit (SSU) processosome; U3 snoRNP protein  40.78 
 
 
515 aa  273  6e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158216  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1722  C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex aNOP56 subunit  44.44 
 
 
409 aa  200  6e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0376  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  35.04 
 
 
412 aa  193  5e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.599925  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1915  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  42.69 
 
 
411 aa  187  4e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1726  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein  42.13 
 
 
420 aa  184  3e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0289991  hitchhiker  0.000329724 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0402  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  39.35 
 
 
420 aa  178  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.143885 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1106  rRNA biogenesis protein Nop56/Nop58  39.81 
 
 
416 aa  178  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1378  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  40.74 
 
 
422 aa  177  5e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00034062  hitchhiker  0.0041241 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0296  C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex aNOP56 subunit  35.96 
 
 
484 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1468  C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex aNOP56 subunit  36.33 
 
 
490 aa  169  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.665023  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1010  C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex aNOP56 subunit  36.33 
 
 
480 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1618  C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex aNOP56 subunit  35.21 
 
 
485 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1284  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  41.2 
 
 
402 aa  161  3e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000448185 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1391  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein  38.96 
 
 
470 aa  160  4e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0760  C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex aNOP56 subunit  34.66 
 
 
493 aa  158  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526132  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0805  rRNA biogenesis protein Nop56/Nop58  37.67 
 
 
336 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1562  rRNA biogenesis protein Nop56/Nop58  32.48 
 
 
354 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.001188  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0693  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  31.25 
 
 
321 aa  120  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.874569  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2237  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  33.98 
 
 
279 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.881727 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2745  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  27.82 
 
 
287 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2086  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  34.43 
 
 
295 aa  110  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0407  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  43.55 
 
 
299 aa  109  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.033854  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1041  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  28.69 
 
 
287 aa  107  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0516  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  27.92 
 
 
289 aa  103  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0541  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  29.91 
 
 
286 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0672918  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_94220  predicted protein  25.38 
 
 
393 aa  100  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1637  hypothetical protein  26.58 
 
 
295 aa  97.1  7e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01260  pre-mRNA splicing factor (Prp31), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10190)  27.4 
 
 
521 aa  95.9  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0917143 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05520  conserved hypothetical protein  28.81 
 
 
553 aa  95.1  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00050956  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0831  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  35.11 
 
 
285 aa  94  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0109  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding domain protein  37.5 
 
 
262 aa  89.4  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.380556  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46989  splicing factor  25.69 
 
 
544 aa  74.7  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.192868  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2265  Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region  43.48 
 
 
295 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310943  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43576  predicted protein  23.23 
 
 
483 aa  70.5  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>