More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2456 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2456  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 257 aa  505  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3564  DeoR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0635844  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4425  DeoR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 258 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612915  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  43.46 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1034  DeoR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 268 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.631262  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1101  transcriptional regulator, DeoR family  38.01 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5838  DeoR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  38.14 
 
 		 256 aa  125  7e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5960  DeoR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  37.76 
 
 		 253 aa  122  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  33.02 
 
 		 250 aa  122  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6298  DeoR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 268 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.7128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1531  DeoR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  34.39 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6957  DeoR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4365  transcriptional regulator, DeoR family  35.68 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  30.97 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  35.98 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2591  DeoR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.759776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.65 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  38.84 
 
 		 268 aa  115  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  37.98 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1442  DeoR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0258355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1483  transcriptional regulator, DeoR family  33.8 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3964  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6108  DeoR family transcriptional regulator  37 
 
 		 268 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1380  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1242  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1218  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.46178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1220  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.373784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1343  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  36.21 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1417  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.381342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  36.77 
 
 		 253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  36.56 
 
 		 253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1243  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.5 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  34.33 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.09 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  34.69 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  34.5 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  34.69 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  34.5 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  34.69 
 
 		 257 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  34.69 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.5 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  34.69 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.5 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.5 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.5 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  34.5 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  37.44 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  36.46 
 
 		 247 aa  109  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  31.39 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  36.32 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  34.62 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3265  transcriptional regulator, DeoR family  38.77 
 
 		 277 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213162  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  34.62 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1053  DeoR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  36.15 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  31.39 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.39 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  31.39 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  31.39 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.39 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  29.17 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.39 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0039  transcriptional regulator, DeoR family  26.39 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000112771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  34.12 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.94 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.94 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 251 aa  105  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 252 aa  105  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  33.17 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  36.51 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3954  DeoR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  34.35 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  39.9 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.94 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.25 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  34.29 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  32.42 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 		 256 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  36.54 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.25 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.61 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>