More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0562 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1678  fumarate lyase  99.5 
 
 		 401 aa  777    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0562  fumarate lyase  100 
 
 		 401 aa  780    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1700  fumarate lyase  99.5 
 
 		 401 aa  777    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1744  fumarate lyase  99.5 
 
 		 401 aa  777    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1728  fumarate lyase  99.5 
 
 		 401 aa  777    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0528  fumarate lyase  99.5 
 
 		 401 aa  777    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0617  fumarate lyase  44.23 
 
 		 446 aa  199  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2833  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  42.97 
 
 		 464 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4076  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  44.85 
 
 		 501 aa  189  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3852  fumarate lyase  43.8 
 
 		 491 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2457  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  41.42 
 
 		 383 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00336692  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7931  3-carboxy-cis,cis-muconate cyclo-isomerase  36.6 
 
 		 452 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4654  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.07 
 
 		 464 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0817649  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1055  fumarate lyase  36.91 
 
 		 488 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2695  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.38 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0450627  normal  0.5058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2324  fumarate lyase  40.21 
 
 		 500 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4314  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.46 
 
 		 459 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417348  normal  0.728676 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13030  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.12 
 
 		 462 aa  146  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0056  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.89 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0457569  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0069  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.89 
 
 		 452 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675451  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0048  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.89 
 
 		 452 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1485  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.89 
 
 		 452 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1202  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.89 
 
 		 452 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0058  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.89 
 
 		 452 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.593603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4654  fumarate lyase  38.08 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2125  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  34.63 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1555  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.58 
 
 		 452 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1579  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.59 
 
 		 448 aa  142  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.13236  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5286  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.38 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4459  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.33 
 
 		 476 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484308 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2341  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  33.24 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0645  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.13 
 
 		 459 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0741414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2084  fumarate lyase  36.67 
 
 		 451 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252524  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3127  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.58 
 
 		 457 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0048  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.53 
 
 		 465 aa  136  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2456  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.89 
 
 		 453 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786558  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2251  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.75 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.001838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3160  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.02 
 
 		 457 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0298  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.3 
 
 		 444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5019  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.02 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2188  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.99 
 
 		 441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5748  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.02 
 
 		 452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.955684  normal  0.122503 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2063  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.02 
 
 		 453 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146832  normal  0.884924 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4015  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.93 
 
 		 490 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0773124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5023  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  32 
 
 		 462 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.261629  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5111  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.71 
 
 		 406 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1657  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.07 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.919998 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02908  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  33.33 
 
 		 450 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1019  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.68 
 
 		 450 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1273  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  32.97 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2505  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  34.47 
 
 		 452 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1536  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  31.52 
 
 		 438 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0157227  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1855  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  34.54 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2418  fumarate lyase  31.88 
 
 		 448 aa  121  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3852  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.71 
 
 		 384 aa  120  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0767232  normal  0.573525 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38190  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.88 
 
 		 450 aa  120  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569484  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3487  fumarate lyase  30.09 
 
 		 450 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1379  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  34.17 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.449914  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4475  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.71 
 
 		 452 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4344  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  33.8 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.339693  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4409  fumarate lyase  32.34 
 
 		 446 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1439  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  30.56 
 
 		 460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4557  fumarate lyase  28.72 
 
 		 449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4837  fumarate lyase  32.28 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.616525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02830  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.45 
 
 		 459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289129 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3811  fumarate lyase  28.46 
 
 		 449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2385  fumarate lyase  33.9 
 
 		 463 aa  114  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.72571  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3622  fumarate lyase  31.5 
 
 		 456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4598  fumarate lyase  31.25 
 
 		 458 aa  113  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604906  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2958  adenylosuccinate lyase  31.58 
 
 		 471 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121926  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1072  adenylosuccinate lyase  34.12 
 
 		 455 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04011  conserved hypothetical protein  31.5 
 
 		 476 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4435  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.59 
 
 		 450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.115184  normal  0.0129696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1483  fumarate lyase  29.16 
 
 		 450 aa  110  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151746  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2745  fumarate lyase  30.22 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.632463  normal  0.0578708 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0316  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.47 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0910  fumarate lyase  33.05 
 
 		 458 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0147  adenylosuccinate lyase  33.58 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0520722  normal  0.203508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0014  fumarate lyase  30.29 
 
 		 450 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000353189  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0280  adenylosuccinate lyase  29.07 
 
 		 454 aa  106  8e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0757  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  28.79 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1217  adenylosuccinate lyase  28.01 
 
 		 457 aa  104  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0739358  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1582  adenylosuccinate lyase  30.31 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0161  adenylosuccinate lyase  29.54 
 
 		 406 aa  103  5e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.576792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3324  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  32.28 
 
 		 402 aa  103  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1393  adenylosuccinate lyase  29.97 
 
 		 455 aa  102  9e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00268576  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1906  putative lyase  29.27 
 
 		 445 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2685  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  33.68 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.1751 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1197  adenylosuccinate lyase  30.26 
 
 		 403 aa  101  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4874  fumarate lyase  28.69 
 
 		 456 aa  100  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0760075  normal  0.0695852 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0018  adenylosuccinate lyase  31.35 
 
 		 458 aa  99.8  8e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.146335  decreased coverage  0.000415583 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5054  fumarate lyase  27.56 
 
 		 456 aa  97.8  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0605282  normal  0.269052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0170  adenylosuccinate lyase  28.1 
 
 		 454 aa  97.8  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00265741  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3729  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  33.9 
 
 		 354 aa  97.4  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1662  fumarate lyase  31.14 
 
 		 438 aa  97.4  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4888  fumarate lyase  44.12 
 
 		 568 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4374  adenylosuccinate lyase  27.61 
 
 		 451 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.25048e-22 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0215  adenylosuccinate lyase  28.18 
 
 		 454 aa  97.1  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.314002  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18850  adenylosuccinate lyase  31.23 
 
 		 483 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1631  adenylosuccinate lyase  30.72 
 
 		 483 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>