More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0147 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0147  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
403 aa  806    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0520722  normal  0.203508 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0161  adenylosuccinate lyase  79.3 
 
 
406 aa  650    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.576792  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0129  fumarate lyase  78.16 
 
 
408 aa  652    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1197  adenylosuccinate lyase  82.84 
 
 
403 aa  689    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1217  adenylosuccinate lyase  44.83 
 
 
457 aa  346  4e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0739358  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0018  adenylosuccinate lyase  45.65 
 
 
458 aa  331  2e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.146335  decreased coverage  0.000415583 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1455  adenylosuccinate lyase  39 
 
 
453 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  36.28 
 
 
446 aa  241  1e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  36.15 
 
 
430 aa  236  5.0000000000000005e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  34.8 
 
 
448 aa  236  8e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  35.14 
 
 
449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  35.86 
 
 
431 aa  233  5e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  36.11 
 
 
431 aa  232  9e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  37.76 
 
 
446 aa  232  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  35.16 
 
 
431 aa  230  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  35.16 
 
 
431 aa  230  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  39.84 
 
 
446 aa  229  9e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1648  adenylosuccinate lyase  34.17 
 
 
431 aa  228  1e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0818  adenylosuccinate lyase  38.54 
 
 
425 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1423  adenylosuccinate lyase  37.02 
 
 
435 aa  226  8e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  34.07 
 
 
431 aa  224  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  35.45 
 
 
430 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  38.56 
 
 
435 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  37.87 
 
 
431 aa  224  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  37.37 
 
 
431 aa  223  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0059  adenylosuccinate lyase  39.55 
 
 
432 aa  223  4.9999999999999996e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.169461  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1218  adenylosuccinate lyase  38.64 
 
 
445 aa  222  8e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  36.83 
 
 
431 aa  220  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  36.17 
 
 
431 aa  220  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0219  adenylosuccinate lyase  34.22 
 
 
432 aa  220  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0391  adenylosuccinate lyase  35.43 
 
 
431 aa  220  3e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000515092 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  36 
 
 
433 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  36.8 
 
 
436 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  34.32 
 
 
430 aa  217  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  35.68 
 
 
448 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  35.48 
 
 
431 aa  217  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1684  adenylosuccinate lyase  35.14 
 
 
449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.29073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  36.51 
 
 
435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  36 
 
 
435 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  35.92 
 
 
431 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1243  adenylosuccinate lyase  33.07 
 
 
427 aa  216  5e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0216  adenylosuccinate lyase  34.89 
 
 
449 aa  216  5e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.595584 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  36 
 
 
435 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  36 
 
 
435 aa  216  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  36 
 
 
435 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  36.02 
 
 
434 aa  216  7e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  36 
 
 
435 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  35.73 
 
 
435 aa  215  9e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  35.73 
 
 
435 aa  215  9e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  35.92 
 
 
430 aa  214  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  35.92 
 
 
447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  35.39 
 
 
431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  36.8 
 
 
436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  35.2 
 
 
435 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  35.98 
 
 
435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  35.9 
 
 
435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  33.25 
 
 
432 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1118  adenylosuccinate lyase  38.6 
 
 
446 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.984181  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1058  adenylosuccinate lyase  37.11 
 
 
436 aa  213  5.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  34.47 
 
 
446 aa  213  7e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  35.66 
 
 
437 aa  212  7.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  35.75 
 
 
431 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  35.92 
 
 
433 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  35.2 
 
 
438 aa  210  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0766  adenylosuccinate lyase  31.23 
 
 
432 aa  210  3e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.401492  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1446  adenylosuccinate lyase  34.13 
 
 
433 aa  210  4e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000278594  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  35.9 
 
 
435 aa  210  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0294  adenylosuccinate lyase  35.7 
 
 
449 aa  210  4e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  35.28 
 
 
434 aa  209  7e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  36.07 
 
 
445 aa  209  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  35.64 
 
 
435 aa  209  8e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  34.85 
 
 
432 aa  208  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  34.41 
 
 
432 aa  208  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  35.37 
 
 
435 aa  208  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1963  adenylosuccinate lyase  37.63 
 
 
433 aa  208  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.700985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  35.22 
 
 
430 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  33.75 
 
 
450 aa  207  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  34.95 
 
 
431 aa  207  4e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  35.28 
 
 
435 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3849  adenylosuccinate lyase  35.64 
 
 
435 aa  206  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  36.87 
 
 
435 aa  206  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1014  adenylosuccinate lyase  36.17 
 
 
437 aa  205  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  35.37 
 
 
435 aa  205  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  35.64 
 
 
435 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2209  adenylosuccinate lyase  35.2 
 
 
431 aa  205  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895264  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3102  adenylosuccinate lyase  35.22 
 
 
436 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.611529  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3019  adenylosuccinate lyase  37.69 
 
 
445 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.472154  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  36.6 
 
 
435 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0991  adenylosuccinate lyase  34.32 
 
 
434 aa  203  4e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1610  adenylosuccinate lyase  35.37 
 
 
435 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  34.58 
 
 
431 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  34.58 
 
 
431 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  31.31 
 
 
433 aa  203  5e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  32.53 
 
 
443 aa  202  6e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  33.96 
 
 
431 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3844  adenylosuccinate lyase  36.63 
 
 
443 aa  202  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0755434  normal  0.0845015 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1701  adenylosuccinate lyase  37.31 
 
 
445 aa  202  8e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.259986  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1526  adenylosuccinate lyase  34.06 
 
 
425 aa  202  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  36.44 
 
 
435 aa  202  9e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2464  adenylosuccinate lyase  33.33 
 
 
438 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.495777  hitchhiker  0.00480262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>