More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0129 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0129  fumarate lyase  100 
 
 		 408 aa  827    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0147  adenylosuccinate lyase  78.16 
 
 		 403 aa  649    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0520722  normal  0.203508 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0161  adenylosuccinate lyase  79.3 
 
 		 406 aa  657    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.576792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1197  adenylosuccinate lyase  75.87 
 
 		 403 aa  648    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1217  adenylosuccinate lyase  49.08 
 
 		 457 aa  343  4e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0739358  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0018  adenylosuccinate lyase  48.22 
 
 		 458 aa  335  7.999999999999999e-91  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.146335  decreased coverage  0.000415583 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1455  adenylosuccinate lyase  38.29 
 
 		 453 aa  255  8e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  37.44 
 
 		 446 aa  249  9e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  36.82 
 
 		 446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  39.26 
 
 		 436 aa  233  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  36.11 
 
 		 431 aa  232  9e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  34.96 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1648  adenylosuccinate lyase  34.68 
 
 		 431 aa  230  3e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1243  adenylosuccinate lyase  34.92 
 
 		 427 aa  230  3e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0219  adenylosuccinate lyase  36.07 
 
 		 432 aa  229  8e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  35.61 
 
 		 431 aa  227  3e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1014  adenylosuccinate lyase  39.88 
 
 		 437 aa  227  3e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  35.09 
 
 		 449 aa  227  4e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  34.5 
 
 		 431 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  34.5 
 
 		 431 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  38.87 
 
 		 430 aa  225  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  34.07 
 
 		 430 aa  225  1e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  37.9 
 
 		 431 aa  225  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1058  adenylosuccinate lyase  37.76 
 
 		 436 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  36.77 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  35.57 
 
 		 448 aa  219  6e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  35.92 
 
 		 431 aa  219  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  38.56 
 
 		 435 aa  219  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0391  adenylosuccinate lyase  35.68 
 
 		 431 aa  219  6e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000515092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0818  adenylosuccinate lyase  39.09 
 
 		 425 aa  219  7e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  36.91 
 
 		 446 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  36.83 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  39.25 
 
 		 431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  36.44 
 
 		 435 aa  216  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  36.8 
 
 		 436 aa  217  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  35.9 
 
 		 435 aa  216  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0059  adenylosuccinate lyase  36.87 
 
 		 432 aa  216  5e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.169461  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  33.25 
 
 		 431 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2293  adenylosuccinate lyase  38.34 
 
 		 441 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.0141392 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1423  adenylosuccinate lyase  35.75 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1011  adenylosuccinate lyase  36.83 
 
 		 431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1218  adenylosuccinate lyase  36.95 
 
 		 445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  36.36 
 
 		 435 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  37.27 
 
 		 431 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  35.23 
 
 		 432 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  36.36 
 
 		 435 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  36.63 
 
 		 443 aa  213  7e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1610  adenylosuccinate lyase  36.17 
 
 		 435 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3019  adenylosuccinate lyase  39.17 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.472154  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  36.1 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  36.1 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  36.36 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  36.1 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  36.02 
 
 		 431 aa  211  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  36.1 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  35.48 
 
 		 434 aa  212  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  35.83 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  35.83 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  36.07 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  35.29 
 
 		 435 aa  211  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  36.6 
 
 		 435 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  35.29 
 
 		 433 aa  211  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  35.64 
 
 		 435 aa  211  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  35.37 
 
 		 435 aa  209  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1684  adenylosuccinate lyase  35.57 
 
 		 449 aa  209  7e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.29073  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  35.75 
 
 		 431 aa  209  8e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  36.34 
 
 		 435 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  33.33 
 
 		 433 aa  209  8e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  36.46 
 
 		 431 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0050  adenylosuccinate lyase  37.17 
 
 		 442 aa  209  9e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1446  adenylosuccinate lyase  34.4 
 
 		 433 aa  209  9e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000278594  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  36.46 
 
 		 431 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  35.37 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0766  adenylosuccinate lyase  28.19 
 
 		 432 aa  208  1e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.401492  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1121  adenylosuccinate lyase  36.9 
 
 		 447 aa  208  1e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  35.64 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3102  adenylosuccinate lyase  36.44 
 
 		 436 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.611529  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0216  adenylosuccinate lyase  35.31 
 
 		 449 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.595584 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0025  adenylosuccinate lyase  37.17 
 
 		 442 aa  208  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4343  adenylosuccinate lyase  35.37 
 
 		 435 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.119583  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  35.73 
 
 		 438 aa  207  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1526  adenylosuccinate lyase  36.51 
 
 		 425 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  36.27 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  35.48 
 
 		 431 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5353  adenylosuccinate lyase  35.9 
 
 		 435 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156814 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1036  adenylosuccinate lyase  34.68 
 
 		 433 aa  207  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  35.39 
 
 		 437 aa  208  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0991  adenylosuccinate lyase  35.92 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  34.55 
 
 		 446 aa  207  3e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  35.9 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  38.07 
 
 		 432 aa  206  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  37.17 
 
 		 442 aa  207  4e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1740  adenylosuccinate lyase  35.29 
 
 		 442 aa  206  4e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.483488  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  33.51 
 
 		 430 aa  207  4e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  34.85 
 
 		 432 aa  206  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  34.75 
 
 		 434 aa  206  5e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  35.73 
 
 		 435 aa  206  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  34.72 
 
 		 447 aa  205  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  35.9 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  33.94 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>