More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0271 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0271  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
372 aa  761    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00147493  normal  0.0721656 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2781  acetyl-CoA acetyltransferase  60.11 
 
 
381 aa  462  1e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0753576  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2782  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.77 
 
 
392 aa  152  7e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.133795  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0270  acetyl-CoA acetyltransferase  29.94 
 
 
391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00178908  normal  0.140204 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  29.51 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  30.35 
 
 
391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  29.43 
 
 
392 aa  123  6e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  30.92 
 
 
387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  28.73 
 
 
395 aa  119  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  29.43 
 
 
387 aa  117  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  30.66 
 
 
387 aa  113  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  29.09 
 
 
387 aa  110  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  28.13 
 
 
396 aa  107  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  29.75 
 
 
388 aa  100  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  26.83 
 
 
387 aa  99  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  27.45 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  28.06 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  30.16 
 
 
390 aa  96.7  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3785  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  29.53 
 
 
380 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0227362  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0841  propanoyl-CoA C-acyltransferase  23.55 
 
 
371 aa  94.7  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000470716 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  30.68 
 
 
383 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  27.98 
 
 
386 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  31.58 
 
 
387 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  26.74 
 
 
393 aa  91.3  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  30.74 
 
 
383 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2763  putative SCP-x_thiolase/acetyl- CoA acetyltransferase, PaaJ-like  25.2 
 
 
400 aa  90.5  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470356  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  26.89 
 
 
388 aa  89  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  30.7 
 
 
387 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.57 
 
 
378 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  27.62 
 
 
388 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  29.65 
 
 
387 aa  88.6  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  27.69 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.22 
 
 
392 aa  87.4  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  24.79 
 
 
386 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.28 
 
 
392 aa  87  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  27.47 
 
 
390 aa  86.7  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  27.88 
 
 
378 aa  86.7  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  32.02 
 
 
394 aa  86.7  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  28.41 
 
 
385 aa  86.3  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.3 
 
 
392 aa  85.9  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  26.61 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  26.27 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3981  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  26.82 
 
 
385 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.480226  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  31.02 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  27 
 
 
387 aa  82.8  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  26.12 
 
 
384 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  29.13 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  26.03 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  30.05 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.55 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3786  acetyl-CoA acetyltransferase  27.15 
 
 
389 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00704604  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  27.32 
 
 
384 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  29.63 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  25.46 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  27.89 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  28.96 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  30.36 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5540  putative acetyl-CoA C-acyltransferase  26.57 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4345  thiolase  28.91 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46112  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  27.47 
 
 
390 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1999  thiolase  27.96 
 
 
381 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  26.2 
 
 
397 aa  76.6  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  26.3 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  27.99 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  26.03 
 
 
389 aa  76.3  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  25.34 
 
 
386 aa  76.3  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  24.86 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  24.86 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  29.66 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  24.86 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  31.28 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2764  putative acetyl-CoA acetyltransferase protein, PaaJ-like  24.87 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.312404  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3588  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  27.13 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193067  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  26.96 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  24.09 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  24.09 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  24.09 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2519  thiolase  24.23 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236528  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  22.53 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  26.5 
 
 
394 aa  72.8  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.093907 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04353  sterol carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06380)  24.16 
 
 
458 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  28.12 
 
 
397 aa  72.8  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  30.58 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  30.58 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3389  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  26.94 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0952002  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  31.53 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1006  acetyl-CoA acetyltransferase  27.08 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0865761  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  26.98 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  28.43 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1242  acetyl-CoA C-acyltransferase  28.27 
 
 
380 aa  70.1  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0529567  normal  0.0106911 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  25.61 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  29.02 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  28.64 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  26.5 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  26.63 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3601  hypothetical protein  27.27 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0450403  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  26.92 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  28.86 
 
 
382 aa  69.3  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  31.07 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  27.19 
 
 
388 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>