More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2131 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2131  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
417 aa  858    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0699  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.46 
 
 
419 aa  620  1e-176  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136765  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0929  nucleotide sugar dehydrogenase  64.51 
 
 
416 aa  560  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3008  nucleotide sugar dehydrogenase  52.18 
 
 
436 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0210  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  51.23 
 
 
440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.125805  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1757  nucleotide sugar dehydrogenase  49.53 
 
 
437 aa  403  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3187  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  49.41 
 
 
437 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.878007  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3259  nucleotide sugar dehydrogenase  50.25 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1910  nucleotide sugar dehydrogenase  48.5 
 
 
437 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2494  nucleotide sugar dehydrogenase  50.47 
 
 
438 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  45.75 
 
 
461 aa  389  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1994  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.41 
 
 
429 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000749227  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0270  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50.48 
 
 
424 aa  390  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.404114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1942  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  48.83 
 
 
428 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.377359  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2214  nucleotide sugar dehydrogenase  47.7 
 
 
439 aa  385  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0680742  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2440  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  50 
 
 
426 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.406564  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0910  UDP-N-acetyl-D-galactosamine 6-dehydrogenase  49.02 
 
 
429 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0667  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  51.11 
 
 
426 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.569284  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1221  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  47.33 
 
 
410 aa  378  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00366346  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0638  nucleotide sugar dehydrogenase  46.45 
 
 
436 aa  379  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5211  nucleotide sugar dehydrogenase  49.18 
 
 
429 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2340  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.67 
 
 
439 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1312  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  46.58 
 
 
437 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1105  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  48.77 
 
 
429 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0098  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  51.43 
 
 
426 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.15381  normal  0.264106 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2112  NDP-sugar dehydrogenase  48.64 
 
 
426 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3392  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronic acid dehydrogenase  46.43 
 
 
432 aa  376  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2441  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.59 
 
 
428 aa  375  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2445  nucleotide sugar dehydrogenase  51.34 
 
 
428 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1917  nucleotide sugar dehydrogenase  45.35 
 
 
438 aa  377  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247022  hitchhiker  0.00141201 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0619  cellulose binding, type IV  47.92 
 
 
427 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5375  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.52 
 
 
425 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3069  nucleotide sugar dehydrogenase  47.31 
 
 
426 aa  372  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1805  nucleotide sugar dehydrogenase  49.06 
 
 
449 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3288  nucleotide sugar dehydrogenase  44.13 
 
 
453 aa  366  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.178741  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2415  nucleotide sugar dehydrogenase  45.63 
 
 
443 aa  365  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000438883 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1550  nucleotide sugar dehydrogenase  43.55 
 
 
424 aa  363  2e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.896349  normal  0.523869 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0613  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.93 
 
 
425 aa  363  2e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.144272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3997  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.58 
 
 
426 aa  363  3e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1754  nucleotide sugar dehydrogenase  47.62 
 
 
428 aa  363  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.470389  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3130  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.5 
 
 
433 aa  362  5.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2494  nucleotide sugar dehydrogenase  47.92 
 
 
428 aa  362  9e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0461  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  47.96 
 
 
410 aa  361  1e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.231921  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2609  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.99 
 
 
420 aa  362  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0202798  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29910  polysaccharide biosynthesis protein  44.82 
 
 
425 aa  360  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00762868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2325  VI polysaccharide biosynthesis protein VipA/tviB  45.85 
 
 
424 aa  359  5e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1553  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  46.17 
 
 
423 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0623  nucleotide sugar dehydrogenase  45.13 
 
 
432 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.786089  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0249  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.93 
 
 
428 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.066145 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1423  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.63 
 
 
421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.807918  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0666  VI polysaccharide biosynthesis protein VipA/tviB  46.63 
 
 
423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.306604  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4077  nucleotide sugar dehydrogenase  44.12 
 
 
444 aa  357  2.9999999999999997e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771769  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1397  VI polysaccharide biosynthesis protein VipA/tviB  47.33 
 
 
405 aa  355  5.999999999999999e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0949  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.88 
 
 
432 aa  355  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2637  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.98 
 
 
425 aa  353  4e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3014  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.79 
 
 
431 aa  353  4e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  44.44 
 
 
425 aa  352  8e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.416504  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4704  nucleotide sugar dehydrogenase  44.77 
 
 
425 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.963115  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1926  nucleotide sugar dehydrogenase  45.39 
 
 
431 aa  352  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544899  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5622  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  45.41 
 
 
427 aa  349  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0664536  normal  0.659782 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0650  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.55 
 
 
425 aa  349  6e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.634824 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0232  nucleotide sugar dehydrogenase  44.36 
 
 
427 aa  348  1e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0611  nucleotide sugar dehydrogenase  43.38 
 
 
429 aa  347  3e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15845  normal  0.0862821 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1493  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.98 
 
 
423 aa  346  5e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887113 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3606  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.86 
 
 
427 aa  345  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.149588 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3190  polysaccharide biosynthesis protein  43.9 
 
 
426 aa  344  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3644  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  43.33 
 
 
426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.329699  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2267  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.77 
 
 
419 aa  343  4e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1176  nucleotide sugar dehydrogenase  48.17 
 
 
443 aa  343  4e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111976  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2543  nucleotide sugar dehydrogenase  42.07 
 
 
429 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0214194  normal  0.0468694 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001773  UDP-glucose dehydrogenase  43.8 
 
 
426 aa  339  5e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.350291  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2973  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.2 
 
 
423 aa  339  5e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0796  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.85 
 
 
439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13083  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  43.12 
 
 
433 aa  336  3.9999999999999995e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28343  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1277  UDP-glucose-6 dehydrogenase, putative  42.72 
 
 
421 aa  334  1e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4763  nucleotide sugar dehydrogenase  42.79 
 
 
442 aa  333  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000048772  normal  0.305749 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1654  nucleotide sugar dehydrogenase  42.09 
 
 
426 aa  328  8e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.974293  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2260  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.34 
 
 
425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0462804  hitchhiker  0.00212267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4788  nucleotide sugar dehydrogenase  42.27 
 
 
421 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0356  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.76 
 
 
429 aa  326  4.0000000000000003e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01511  VI polysaccharide biosynthesis protein VipA/tviB  41.48 
 
 
430 aa  324  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.098059  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3952  nucleotide sugar dehydrogenase  40.87 
 
 
424 aa  322  5e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0821  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.26 
 
 
431 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1431  nucleotide sugar dehydrogenase  40.45 
 
 
428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4734  nucleotide sugar dehydrogenase  41.29 
 
 
428 aa  320  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740891  hitchhiker  0.000167734 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1201  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.59 
 
 
425 aa  320  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20693  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0525  polysaccharide biosynthetic protein  40.71 
 
 
430 aa  311  2e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.163274  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0464  nucleotide sugar dehydrogenase  40.48 
 
 
430 aa  311  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148453  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3150  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.78 
 
 
441 aa  309  5.9999999999999995e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1202  nucleotide sugar dehydrogenase  40.39 
 
 
423 aa  305  8.000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.358663  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0240  nucleotide sugar dehydrogenase  38.85 
 
 
453 aa  279  7e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.836377  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  38.82 
 
 
434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0636  nucleotide sugar dehydrogenase  39.39 
 
 
439 aa  271  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2168  nucleotide sugar dehydrogenase  37.56 
 
 
426 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4504  nucleotide sugar dehydrogenase  36.52 
 
 
451 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3852  nucleotide sugar dehydrogenase  37.59 
 
 
453 aa  264  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199691  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1238  nucleotide sugar dehydrogenase  37.72 
 
 
437 aa  263  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.836268  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0575  nucleotide sugar dehydrogenase  37.12 
 
 
432 aa  259  6e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0705  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.73 
 
 
438 aa  257  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000613921  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2529  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.78 
 
 
439 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>