More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3150 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3150  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  100 
 
 
441 aa  893    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1201  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  65.29 
 
 
425 aa  513  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20693  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0619  cellulose binding, type IV  54.07 
 
 
427 aa  450  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5211  nucleotide sugar dehydrogenase  54.7 
 
 
429 aa  436  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0796  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  52.35 
 
 
439 aa  438  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3187  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  54.2 
 
 
437 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.878007  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2112  NDP-sugar dehydrogenase  54.27 
 
 
426 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3259  nucleotide sugar dehydrogenase  52.68 
 
 
426 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2415  nucleotide sugar dehydrogenase  55.31 
 
 
443 aa  427  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000438883 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2609  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  53.41 
 
 
420 aa  428  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0202798  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2494  nucleotide sugar dehydrogenase  54.93 
 
 
438 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1994  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  53.97 
 
 
429 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000749227  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1553  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  53.72 
 
 
423 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5622  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  53.16 
 
 
427 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0664536  normal  0.659782 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2445  nucleotide sugar dehydrogenase  55.45 
 
 
428 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0210  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  53.29 
 
 
440 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.125805  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0232  nucleotide sugar dehydrogenase  53.9 
 
 
427 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3190  polysaccharide biosynthesis protein  50.47 
 
 
426 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2637  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50 
 
 
425 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1805  nucleotide sugar dehydrogenase  54.96 
 
 
449 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0356  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.54 
 
 
429 aa  415  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1942  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  54.31 
 
 
428 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.377359  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0461  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  49.41 
 
 
410 aa  412  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.231921  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0613  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50.23 
 
 
425 aa  412  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.144272 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2441  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  52.57 
 
 
428 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13083  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  49.43 
 
 
433 aa  414  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28343  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1312  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50.23 
 
 
437 aa  414  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001773  UDP-glucose dehydrogenase  50.71 
 
 
426 aa  408  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.350291  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3069  nucleotide sugar dehydrogenase  52.55 
 
 
426 aa  408  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0611  nucleotide sugar dehydrogenase  53.41 
 
 
429 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15845  normal  0.0862821 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0623  nucleotide sugar dehydrogenase  48.38 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.786089  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3606  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  51.89 
 
 
427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.149588 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0910  UDP-N-acetyl-D-galactosamine 6-dehydrogenase  51.08 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1105  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  51.08 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1910  nucleotide sugar dehydrogenase  52.2 
 
 
437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1757  nucleotide sugar dehydrogenase  48.29 
 
 
437 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4704  nucleotide sugar dehydrogenase  50.71 
 
 
425 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.963115  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0650  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.01 
 
 
425 aa  404  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.634824 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5375  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50.47 
 
 
425 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3997  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  51.3 
 
 
426 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3008  nucleotide sugar dehydrogenase  51.94 
 
 
436 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1221  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  50.12 
 
 
410 aa  404  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00366346  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1654  nucleotide sugar dehydrogenase  49.77 
 
 
426 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.974293  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29910  polysaccharide biosynthesis protein  52.36 
 
 
425 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00762868  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1754  nucleotide sugar dehydrogenase  52.87 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.470389  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4788  nucleotide sugar dehydrogenase  50.71 
 
 
421 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406886 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0249  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.41 
 
 
428 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.066145 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3644  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  47.78 
 
 
426 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.329699  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1550  nucleotide sugar dehydrogenase  51.18 
 
 
424 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.896349  normal  0.523869 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2543  nucleotide sugar dehydrogenase  51.06 
 
 
429 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0214194  normal  0.0468694 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0098  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  51.04 
 
 
426 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.15381  normal  0.264106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1926  nucleotide sugar dehydrogenase  50.72 
 
 
431 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2494  nucleotide sugar dehydrogenase  52.87 
 
 
428 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3392  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronic acid dehydrogenase  48.22 
 
 
432 aa  395  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1493  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.82 
 
 
423 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887113 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0638  nucleotide sugar dehydrogenase  47.07 
 
 
436 aa  396  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  49.53 
 
 
425 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.416504  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0270  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.48 
 
 
424 aa  393  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.404114  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0821  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.67 
 
 
431 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1397  VI polysaccharide biosynthesis protein VipA/tviB  51.02 
 
 
405 aa  393  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2325  VI polysaccharide biosynthesis protein VipA/tviB  47.26 
 
 
424 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3130  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.88 
 
 
433 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1277  UDP-glucose-6 dehydrogenase, putative  47.96 
 
 
421 aa  389  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1423  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  46.15 
 
 
421 aa  390  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.807918  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0666  VI polysaccharide biosynthesis protein VipA/tviB  45.39 
 
 
423 aa  388  1e-107  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.306604  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3014  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50.84 
 
 
431 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2440  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  48.49 
 
 
426 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.406564  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0667  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.42 
 
 
426 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.569284  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3952  nucleotide sugar dehydrogenase  47.65 
 
 
424 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2973  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.06 
 
 
423 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2260  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.17 
 
 
425 aa  386  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0462804  hitchhiker  0.00212267 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4077  nucleotide sugar dehydrogenase  47.49 
 
 
444 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771769  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2267  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.49 
 
 
419 aa  381  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0949  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.03 
 
 
432 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1176  nucleotide sugar dehydrogenase  51.71 
 
 
443 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111976  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4763  nucleotide sugar dehydrogenase  47.38 
 
 
442 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000048772  normal  0.305749 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01511  VI polysaccharide biosynthesis protein VipA/tviB  47.82 
 
 
430 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.098059  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2214  nucleotide sugar dehydrogenase  45.41 
 
 
439 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0680742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4734  nucleotide sugar dehydrogenase  48.16 
 
 
428 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740891  hitchhiker  0.000167734 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2340  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.67 
 
 
439 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1202  nucleotide sugar dehydrogenase  46.54 
 
 
423 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.358663  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1917  nucleotide sugar dehydrogenase  45.43 
 
 
438 aa  358  9.999999999999999e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247022  hitchhiker  0.00141201 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0525  polysaccharide biosynthetic protein  46.79 
 
 
430 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.163274  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1431  nucleotide sugar dehydrogenase  47.33 
 
 
428 aa  350  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0464  nucleotide sugar dehydrogenase  46.32 
 
 
430 aa  351  2e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148453  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0929  nucleotide sugar dehydrogenase  44.5 
 
 
416 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3288  nucleotide sugar dehydrogenase  42.04 
 
 
453 aa  326  6e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.178741  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2131  nucleotide sugar dehydrogenase  43.78 
 
 
417 aa  323  3e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0699  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.63 
 
 
419 aa  319  5e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136765  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  41 
 
 
461 aa  308  9e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  33.97 
 
 
434 aa  275  9e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0636  nucleotide sugar dehydrogenase  38.52 
 
 
439 aa  251  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1238  nucleotide sugar dehydrogenase  33.25 
 
 
437 aa  236  6e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.836268  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0240  nucleotide sugar dehydrogenase  36.04 
 
 
453 aa  231  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.836377  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0705  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.05 
 
 
438 aa  229  9e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000613921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0423  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.6 
 
 
414 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0509  putative polysaccharide biosynthesis protein  35.97 
 
 
413 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5968  nucleotide sugar dehydrogenase  37.56 
 
 
445 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2474  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.24 
 
 
449 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4814  putative polysaccharide biosynthesis protein  36.51 
 
 
414 aa  224  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>