More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0705 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0705  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
438 aa  896    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000613921  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0636  nucleotide sugar dehydrogenase  67.52 
 
 
439 aa  619  1e-176  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1238  nucleotide sugar dehydrogenase  67.44 
 
 
437 aa  597  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.836268  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0335  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61 
 
 
434 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0353  nucleotide sugar dehydrogenase  61 
 
 
434 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0961  nucleotide sugar dehydrogenase  60.41 
 
 
435 aa  537  1e-151  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3256  nucleotide sugar dehydrogenase  58.78 
 
 
437 aa  527  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0023  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.17 
 
 
432 aa  523  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576582  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1339  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.14 
 
 
434 aa  523  1e-147  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0359  nucleotide sugar dehydrogenase  54.92 
 
 
439 aa  463  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0575  nucleotide sugar dehydrogenase  54.92 
 
 
432 aa  457  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4504  nucleotide sugar dehydrogenase  50.91 
 
 
451 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1675  nucleotide sugar dehydrogenase  51.64 
 
 
440 aa  430  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160013  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1480  nucleotide sugar dehydrogenase  47.24 
 
 
448 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.4016  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1553  nucleotide sugar dehydrogenase  46.28 
 
 
440 aa  418  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1384  nucleotide sugar dehydrogenase  47 
 
 
448 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2863  nucleotide sugar dehydrogenase  47.84 
 
 
447 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2833  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.61 
 
 
448 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2474  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.44 
 
 
449 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1673  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.67 
 
 
435 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3827  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.91 
 
 
438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.10325  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2396  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.51 
 
 
435 aa  402  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3870  nucleotide sugar dehydrogenase  46.97 
 
 
442 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4103  nucleotide sugar dehydrogenase  45.8 
 
 
441 aa  401  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3083  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.79 
 
 
435 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1857  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  46.37 
 
 
438 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3939  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  46.56 
 
 
505 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809757  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1508  nucleotide sugar dehydrogenase  45.41 
 
 
434 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0376  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.73 
 
 
420 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0162  nucleotide sugar dehydrogenase  45.74 
 
 
420 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.454835  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4292  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.24 
 
 
440 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0487  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.41 
 
 
447 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4278  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.7 
 
 
441 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5968  nucleotide sugar dehydrogenase  44.95 
 
 
445 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4429  nucleotide sugar dehydrogenase  47.47 
 
 
440 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5249  nucleotide sugar dehydrogenase  44.79 
 
 
446 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4451  nucleotide sugar dehydrogenase  47.31 
 
 
441 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7121  nucleotide sugar dehydrogenase  44.72 
 
 
450 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168128  normal  0.1616 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4419  nucleotide sugar dehydrogenase  45.62 
 
 
440 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2856  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  41.12 
 
 
442 aa  368  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  hitchhiker  0.00000634421 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1229  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.08 
 
 
442 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.425997  normal  0.200381 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1299  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.89 
 
 
441 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.165052  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6764  nucleotide sugar dehydrogenase  44.37 
 
 
456 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0817646  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5667  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.79 
 
 
442 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0209397 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1818  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.2 
 
 
439 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.387792  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2167  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.15 
 
 
442 aa  363  3e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.959713  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26760  nucleotide sugar dehydrogenase  43.2 
 
 
416 aa  363  3e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6571  nucleotide sugar dehydrogenase  43.95 
 
 
443 aa  359  5e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.430897  normal  0.0960197 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4589  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.09 
 
 
465 aa  358  9e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338579  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3852  nucleotide sugar dehydrogenase  43.2 
 
 
453 aa  355  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199691  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2529  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.86 
 
 
439 aa  354  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1309  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.53 
 
 
450 aa  347  3e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0281238  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1688  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.72 
 
 
418 aa  344  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833152  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6488  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.45 
 
 
419 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7640  nucleotide sugar dehydrogenase  42.08 
 
 
418 aa  341  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0240  nucleotide sugar dehydrogenase  43.39 
 
 
453 aa  339  5e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.836377  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05630  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  40.29 
 
 
417 aa  337  2.9999999999999997e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2807  nucleotide sugar dehydrogenase  41.2 
 
 
428 aa  335  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2164  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.13 
 
 
471 aa  332  6e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0509  putative polysaccharide biosynthesis protein  39.38 
 
 
413 aa  328  8e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0429  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.48 
 
 
423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0562  putative polysaccharide biosynthesis protein  38.15 
 
 
414 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0560  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  38.66 
 
 
414 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0417  UDP-N-acetyl-D-mannosamine 6-dehydrogenase  38.42 
 
 
414 aa  318  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0421  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  38.42 
 
 
414 aa  317  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0487  putative polysaccharide biosynthesis protein  38.42 
 
 
413 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0423  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.52 
 
 
414 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4814  putative polysaccharide biosynthesis protein  38.57 
 
 
414 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3843  nucleotide sugar dehydrogenase  42.58 
 
 
415 aa  297  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0234219  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  38.5 
 
 
461 aa  293  3e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3392  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronic acid dehydrogenase  38.25 
 
 
432 aa  293  6e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0638  nucleotide sugar dehydrogenase  37.88 
 
 
436 aa  286  2.9999999999999996e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3559  nucleotide sugar dehydrogenase  38.85 
 
 
461 aa  286  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0210  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.56 
 
 
440 aa  286  7e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.125805  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1493  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.66 
 
 
423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887113 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3259  nucleotide sugar dehydrogenase  39.2 
 
 
426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4644  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38 
 
 
436 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4732  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38 
 
 
436 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5027  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38 
 
 
436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0619  cellulose binding, type IV  38.06 
 
 
427 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0650  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.42 
 
 
425 aa  283  6.000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.634824 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2267  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.78 
 
 
419 aa  282  7.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2415  nucleotide sugar dehydrogenase  37.69 
 
 
443 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000438883 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3187  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  38.61 
 
 
437 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.878007  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0929  nucleotide sugar dehydrogenase  41.03 
 
 
416 aa  281  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3644  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  39.55 
 
 
426 aa  280  4e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.329699  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3069  nucleotide sugar dehydrogenase  41.64 
 
 
426 aa  279  6e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3190  polysaccharide biosynthesis protein  34.93 
 
 
426 aa  279  8e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1431  nucleotide sugar dehydrogenase  35.44 
 
 
428 aa  278  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2637  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.62 
 
 
425 aa  277  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0270  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.21 
 
 
424 aa  276  4e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.404114  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2494  nucleotide sugar dehydrogenase  37 
 
 
438 aa  276  5e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3288  nucleotide sugar dehydrogenase  36.04 
 
 
453 aa  275  8e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.178741  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1312  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.47 
 
 
437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001773  UDP-glucose dehydrogenase  37.37 
 
 
426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.350291  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1225  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.63 
 
 
477 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2131  nucleotide sugar dehydrogenase  39.95 
 
 
417 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0699  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.06 
 
 
419 aa  273  6e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136765  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1221  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  35.92 
 
 
410 aa  272  7e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00366346  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2325  VI polysaccharide biosynthesis protein VipA/tviB  37.09 
 
 
424 aa  272  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>