More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1309 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1309  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  100 
 
 
450 aa  898    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0281238  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2164  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  79.38 
 
 
471 aa  620  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6488  lipopolysaccharide biosynthesis protein  69.53 
 
 
419 aa  559  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7640  nucleotide sugar dehydrogenase  67.65 
 
 
418 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05630  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  58.65 
 
 
417 aa  488  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0162  nucleotide sugar dehydrogenase  52.94 
 
 
420 aa  413  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.454835  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26760  nucleotide sugar dehydrogenase  50.12 
 
 
416 aa  386  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0376  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.94 
 
 
420 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1238  nucleotide sugar dehydrogenase  44.58 
 
 
437 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.836268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3852  nucleotide sugar dehydrogenase  49.77 
 
 
453 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199691  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3083  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.62 
 
 
435 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1688  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  51.23 
 
 
418 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833152  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2529  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.64 
 
 
439 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0575  nucleotide sugar dehydrogenase  42.14 
 
 
432 aa  365  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2396  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.83 
 
 
435 aa  365  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3939  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.79 
 
 
505 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809757  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1299  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.87 
 
 
441 aa  364  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.165052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4504  nucleotide sugar dehydrogenase  45.97 
 
 
451 aa  364  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3256  nucleotide sugar dehydrogenase  45.83 
 
 
437 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1553  nucleotide sugar dehydrogenase  48.17 
 
 
440 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4103  nucleotide sugar dehydrogenase  45.75 
 
 
441 aa  362  7.0000000000000005e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0636  nucleotide sugar dehydrogenase  45.91 
 
 
439 aa  360  3e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1384  nucleotide sugar dehydrogenase  47.07 
 
 
448 aa  359  5e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1673  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.85 
 
 
435 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1480  nucleotide sugar dehydrogenase  47.47 
 
 
448 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.4016  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5968  nucleotide sugar dehydrogenase  46 
 
 
445 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2474  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.73 
 
 
449 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323827  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2863  nucleotide sugar dehydrogenase  43.5 
 
 
447 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0961  nucleotide sugar dehydrogenase  42.3 
 
 
435 aa  353  2e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0487  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.08 
 
 
447 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0353  nucleotide sugar dehydrogenase  44.5 
 
 
434 aa  350  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0335  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.5 
 
 
434 aa  350  2e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1508  nucleotide sugar dehydrogenase  45.21 
 
 
434 aa  350  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4429  nucleotide sugar dehydrogenase  47.85 
 
 
440 aa  349  7e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3827  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.32 
 
 
438 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.10325  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7121  nucleotide sugar dehydrogenase  46.25 
 
 
450 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168128  normal  0.1616 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4292  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.37 
 
 
440 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4451  nucleotide sugar dehydrogenase  47.61 
 
 
441 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1818  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.93 
 
 
439 aa  345  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.387792  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1857  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.9 
 
 
438 aa  345  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2833  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.03 
 
 
448 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1229  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.43 
 
 
442 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.425997  normal  0.200381 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2167  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.89 
 
 
442 aa  336  5e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.959713  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0023  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.93 
 
 
432 aa  336  5.999999999999999e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576582  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4419  nucleotide sugar dehydrogenase  43.53 
 
 
440 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1339  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.38 
 
 
434 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4589  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.43 
 
 
465 aa  331  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338579  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3870  nucleotide sugar dehydrogenase  43.29 
 
 
442 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0705  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.9 
 
 
438 aa  330  3e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000613921  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1675  nucleotide sugar dehydrogenase  44.19 
 
 
440 aa  329  6e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160013  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5249  nucleotide sugar dehydrogenase  44.07 
 
 
446 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4278  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.2 
 
 
441 aa  325  7e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0359  nucleotide sugar dehydrogenase  44.11 
 
 
439 aa  325  8.000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6764  nucleotide sugar dehydrogenase  47.04 
 
 
456 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0817646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0429  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.35 
 
 
423 aa  316  4e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5667  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.64 
 
 
442 aa  315  7e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0209397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6571  nucleotide sugar dehydrogenase  47.1 
 
 
443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.430897  normal  0.0960197 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0509  putative polysaccharide biosynthesis protein  38.65 
 
 
413 aa  312  9e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2856  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  36.19 
 
 
442 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  hitchhiker  0.00000634421 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0417  UDP-N-acetyl-D-mannosamine 6-dehydrogenase  38.01 
 
 
414 aa  300  5e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0560  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  38.59 
 
 
414 aa  299  9e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0421  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  37.77 
 
 
414 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0562  putative polysaccharide biosynthesis protein  38.83 
 
 
414 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0487  putative polysaccharide biosynthesis protein  37.92 
 
 
413 aa  295  8e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0240  nucleotide sugar dehydrogenase  37.79 
 
 
453 aa  292  7e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.836377  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2807  nucleotide sugar dehydrogenase  36.13 
 
 
428 aa  292  7e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4814  putative polysaccharide biosynthesis protein  37.62 
 
 
414 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0423  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.41 
 
 
414 aa  280  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3843  nucleotide sugar dehydrogenase  45.23 
 
 
415 aa  273  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0234219  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3559  nucleotide sugar dehydrogenase  40.72 
 
 
461 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3259  nucleotide sugar dehydrogenase  36.64 
 
 
426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0638  nucleotide sugar dehydrogenase  35.7 
 
 
436 aa  241  2.9999999999999997e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1225  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.36 
 
 
477 aa  240  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1733  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.6 
 
 
427 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.720088 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0178  nucleotide sugar dehydrogenase  33.65 
 
 
427 aa  239  8e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  38.01 
 
 
461 aa  239  9e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1221  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  35.8 
 
 
410 aa  237  4e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00366346  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3187  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  37.59 
 
 
437 aa  236  8e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.878007  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2267  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.49 
 
 
419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1431  nucleotide sugar dehydrogenase  40.75 
 
 
428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3288  nucleotide sugar dehydrogenase  37.56 
 
 
453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.178741  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0870  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.79 
 
 
427 aa  234  3e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.710609  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3871  nucleotide sugar dehydrogenase  37.32 
 
 
407 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3116  nucleotide sugar dehydrogenase  34.09 
 
 
424 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000525581  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3392  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronic acid dehydrogenase  34.99 
 
 
432 aa  231  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0461  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  34.22 
 
 
410 aa  230  5e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.231921  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3606  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.09 
 
 
427 aa  229  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.149588 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4077  nucleotide sugar dehydrogenase  37.06 
 
 
444 aa  229  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771769  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2131  nucleotide sugar dehydrogenase  35.03 
 
 
417 aa  229  8e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4644  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.97 
 
 
436 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4732  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.97 
 
 
436 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5027  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.97 
 
 
436 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  35.93 
 
 
425 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.416504  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  35.9 
 
 
424 aa  228  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0320263  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1550  nucleotide sugar dehydrogenase  38.29 
 
 
424 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.896349  normal  0.523869 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2304  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.14 
 
 
457 aa  228  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1397  VI polysaccharide biosynthesis protein VipA/tviB  33.75 
 
 
405 aa  227  3e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0464  nucleotide sugar dehydrogenase  38.75 
 
 
430 aa  226  6e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148453  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0525  polysaccharide biosynthetic protein  38.75 
 
 
430 aa  226  6e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.163274  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3008  nucleotide sugar dehydrogenase  37.34 
 
 
436 aa  225  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>