More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3843 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3843  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
415 aa  810    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0234219  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2529  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  56.79 
 
 
439 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0162  nucleotide sugar dehydrogenase  56.3 
 
 
420 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.454835  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3852  nucleotide sugar dehydrogenase  56.79 
 
 
453 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199691  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1688  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  55.29 
 
 
418 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833152  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0376  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.57 
 
 
420 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26760  nucleotide sugar dehydrogenase  54.32 
 
 
416 aa  417  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1238  nucleotide sugar dehydrogenase  43.96 
 
 
437 aa  363  3e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.836268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4504  nucleotide sugar dehydrogenase  43.13 
 
 
451 aa  352  5e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3083  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.12 
 
 
435 aa  351  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2396  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.9 
 
 
435 aa  350  3e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0353  nucleotide sugar dehydrogenase  44.2 
 
 
434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0335  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.2 
 
 
434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1339  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.29 
 
 
434 aa  334  2e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0023  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.79 
 
 
432 aa  332  5e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576582  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0636  nucleotide sugar dehydrogenase  44.04 
 
 
439 aa  330  3e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0961  nucleotide sugar dehydrogenase  40.83 
 
 
435 aa  330  4e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1553  nucleotide sugar dehydrogenase  44.88 
 
 
440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2474  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.11 
 
 
449 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323827  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1384  nucleotide sugar dehydrogenase  44.98 
 
 
448 aa  322  8e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0359  nucleotide sugar dehydrogenase  43 
 
 
439 aa  321  9.999999999999999e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1480  nucleotide sugar dehydrogenase  44.98 
 
 
448 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.4016  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0575  nucleotide sugar dehydrogenase  37.44 
 
 
432 aa  318  9e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3256  nucleotide sugar dehydrogenase  41.9 
 
 
437 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05630  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  44.76 
 
 
417 aa  317  2e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2863  nucleotide sugar dehydrogenase  41.48 
 
 
447 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4103  nucleotide sugar dehydrogenase  40.74 
 
 
441 aa  317  3e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1299  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.94 
 
 
441 aa  316  4e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.165052  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3939  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.94 
 
 
505 aa  313  4.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1673  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.63 
 
 
435 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5968  nucleotide sugar dehydrogenase  42.2 
 
 
445 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3827  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.74 
 
 
438 aa  310  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.10325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7640  nucleotide sugar dehydrogenase  44.29 
 
 
418 aa  311  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0705  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.69 
 
 
438 aa  310  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000613921  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1508  nucleotide sugar dehydrogenase  40.25 
 
 
434 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2164  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  46.99 
 
 
471 aa  306  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1857  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.15 
 
 
438 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1309  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.63 
 
 
450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0281238  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0487  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.61 
 
 
447 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7121  nucleotide sugar dehydrogenase  46.07 
 
 
450 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168128  normal  0.1616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6488  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.99 
 
 
419 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4278  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.83 
 
 
441 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1818  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.69 
 
 
439 aa  299  7e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.387792  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0240  nucleotide sugar dehydrogenase  42.94 
 
 
453 aa  298  1e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.836377  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4589  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.22 
 
 
465 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338579  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4429  nucleotide sugar dehydrogenase  41.85 
 
 
440 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3870  nucleotide sugar dehydrogenase  39.45 
 
 
442 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4451  nucleotide sugar dehydrogenase  41.85 
 
 
441 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4292  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.85 
 
 
440 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4419  nucleotide sugar dehydrogenase  43.07 
 
 
440 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2807  nucleotide sugar dehydrogenase  38.76 
 
 
428 aa  294  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0562  putative polysaccharide biosynthesis protein  36.43 
 
 
414 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1675  nucleotide sugar dehydrogenase  40.74 
 
 
440 aa  292  6e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160013  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0417  UDP-N-acetyl-D-mannosamine 6-dehydrogenase  36.69 
 
 
414 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0560  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  35.71 
 
 
414 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0509  putative polysaccharide biosynthesis protein  36.84 
 
 
413 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0421  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  36.45 
 
 
414 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5667  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.57 
 
 
442 aa  290  4e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0209397 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5249  nucleotide sugar dehydrogenase  40.34 
 
 
446 aa  290  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4814  putative polysaccharide biosynthesis protein  36.04 
 
 
414 aa  289  6e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0487  putative polysaccharide biosynthesis protein  36.69 
 
 
413 aa  289  7e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0429  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.01 
 
 
423 aa  288  9e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2167  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.62 
 
 
442 aa  288  9e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.959713  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2833  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.35 
 
 
448 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0423  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.41 
 
 
414 aa  288  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6571  nucleotide sugar dehydrogenase  44.72 
 
 
443 aa  285  8e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.430897  normal  0.0960197 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1229  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.27 
 
 
442 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.425997  normal  0.200381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6764  nucleotide sugar dehydrogenase  43.21 
 
 
456 aa  276  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0817646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2856  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  37.18 
 
 
442 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  hitchhiker  0.00000634421 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1225  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.02 
 
 
477 aa  268  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3559  nucleotide sugar dehydrogenase  40.48 
 
 
461 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4644  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.1 
 
 
436 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4732  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.1 
 
 
436 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5027  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.1 
 
 
436 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0619  cellulose binding, type IV  39.74 
 
 
427 aa  244  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3259  nucleotide sugar dehydrogenase  36.52 
 
 
426 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0461  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  34.4 
 
 
410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.231921  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1550  nucleotide sugar dehydrogenase  40 
 
 
424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.896349  normal  0.523869 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2415  nucleotide sugar dehydrogenase  38.76 
 
 
443 aa  234  3e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000438883 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1431  nucleotide sugar dehydrogenase  40.39 
 
 
428 aa  233  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3288  nucleotide sugar dehydrogenase  39.83 
 
 
453 aa  232  7.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.178741  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3187  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  39.69 
 
 
437 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.878007  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3069  nucleotide sugar dehydrogenase  38.76 
 
 
426 aa  232  9e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0525  polysaccharide biosynthetic protein  39.6 
 
 
430 aa  232  1e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.163274  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0464  nucleotide sugar dehydrogenase  39.6 
 
 
430 aa  231  2e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148453  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01511  VI polysaccharide biosynthesis protein VipA/tviB  39.01 
 
 
430 aa  229  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.098059  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2267  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.6 
 
 
419 aa  227  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1221  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  35.03 
 
 
410 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00366346  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1312  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.85 
 
 
437 aa  226  8e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0210  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.42 
 
 
440 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.125805  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  40.11 
 
 
461 aa  224  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0929  nucleotide sugar dehydrogenase  36.25 
 
 
416 aa  224  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0633  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.94 
 
 
435 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1591  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.67 
 
 
431 aa  224  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117032  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0611  nucleotide sugar dehydrogenase  36.87 
 
 
429 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15845  normal  0.0862821 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2112  NDP-sugar dehydrogenase  37.31 
 
 
426 aa  223  6e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3871  nucleotide sugar dehydrogenase  35.54 
 
 
407 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3008  nucleotide sugar dehydrogenase  36.3 
 
 
436 aa  222  9e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3148  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.39 
 
 
434 aa  222  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442778  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1910  nucleotide sugar dehydrogenase  38.32 
 
 
437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>