More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0353 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0353  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
434 aa  875    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0335  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
434 aa  875    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0023  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.21 
 
 
432 aa  625  1e-178  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576582  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1339  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.61 
 
 
434 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0961  nucleotide sugar dehydrogenase  69.41 
 
 
435 aa  609  1e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1238  nucleotide sugar dehydrogenase  68.15 
 
 
437 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.836268  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3256  nucleotide sugar dehydrogenase  61.65 
 
 
437 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0705  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.18 
 
 
438 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000613921  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0636  nucleotide sugar dehydrogenase  57.14 
 
 
439 aa  502  1e-141  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4504  nucleotide sugar dehydrogenase  56.22 
 
 
451 aa  491  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0575  nucleotide sugar dehydrogenase  58.11 
 
 
432 aa  482  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0359  nucleotide sugar dehydrogenase  55.99 
 
 
439 aa  462  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2863  nucleotide sugar dehydrogenase  53.56 
 
 
447 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1553  nucleotide sugar dehydrogenase  50.91 
 
 
440 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3827  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.31 
 
 
438 aa  440  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.10325  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1675  nucleotide sugar dehydrogenase  54.15 
 
 
440 aa  432  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160013  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1673  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50.58 
 
 
435 aa  431  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1384  nucleotide sugar dehydrogenase  50.46 
 
 
448 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2474  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.89 
 
 
449 aa  425  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323827  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4103  nucleotide sugar dehydrogenase  49.54 
 
 
441 aa  426  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1480  nucleotide sugar dehydrogenase  50.23 
 
 
448 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.4016  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3083  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.83 
 
 
435 aa  422  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2396  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.3 
 
 
435 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1818  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.71 
 
 
439 aa  420  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.387792  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1508  nucleotide sugar dehydrogenase  49.3 
 
 
434 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1857  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.45 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1299  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.71 
 
 
441 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.165052  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4278  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.29 
 
 
441 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4429  nucleotide sugar dehydrogenase  51.3 
 
 
440 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3870  nucleotide sugar dehydrogenase  48.85 
 
 
442 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4419  nucleotide sugar dehydrogenase  48.83 
 
 
440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4292  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.59 
 
 
440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4451  nucleotide sugar dehydrogenase  51.06 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2167  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.54 
 
 
442 aa  403  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.959713  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0487  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50.59 
 
 
447 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3939  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.88 
 
 
505 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809757  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5968  nucleotide sugar dehydrogenase  46.91 
 
 
445 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4589  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.71 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338579  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5249  nucleotide sugar dehydrogenase  47.28 
 
 
446 aa  398  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7121  nucleotide sugar dehydrogenase  46.22 
 
 
450 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168128  normal  0.1616 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2833  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.72 
 
 
448 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0162  nucleotide sugar dehydrogenase  49.75 
 
 
420 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.454835  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1229  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.07 
 
 
442 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.425997  normal  0.200381 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2529  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  51.15 
 
 
439 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6764  nucleotide sugar dehydrogenase  50.59 
 
 
456 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0817646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6571  nucleotide sugar dehydrogenase  48.94 
 
 
443 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.430897  normal  0.0960197 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2856  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  42.33 
 
 
442 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  hitchhiker  0.00000634421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0376  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.14 
 
 
420 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5667  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.51 
 
 
442 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0209397 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0240  nucleotide sugar dehydrogenase  47.75 
 
 
453 aa  371  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.836377  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3852  nucleotide sugar dehydrogenase  48.37 
 
 
453 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199691  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1688  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.09 
 
 
418 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833152  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26760  nucleotide sugar dehydrogenase  47.22 
 
 
416 aa  365  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0429  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.45 
 
 
423 aa  359  4e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0509  putative polysaccharide biosynthesis protein  42.38 
 
 
413 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1309  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.5 
 
 
450 aa  350  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0281238  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0417  UDP-N-acetyl-D-mannosamine 6-dehydrogenase  41.13 
 
 
414 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2807  nucleotide sugar dehydrogenase  41.67 
 
 
428 aa  348  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0562  putative polysaccharide biosynthesis protein  40.76 
 
 
414 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0560  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  41.23 
 
 
414 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7640  nucleotide sugar dehydrogenase  45.7 
 
 
418 aa  347  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0421  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  40.66 
 
 
414 aa  346  5e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05630  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  42.4 
 
 
417 aa  342  8e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0487  putative polysaccharide biosynthesis protein  40.71 
 
 
413 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6488  lipopolysaccharide biosynthesis protein  45.28 
 
 
419 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4814  putative polysaccharide biosynthesis protein  40.76 
 
 
414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0423  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.28 
 
 
414 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2164  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.96 
 
 
471 aa  335  7e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3843  nucleotide sugar dehydrogenase  45.75 
 
 
415 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0234219  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5027  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.48 
 
 
436 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4644  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.48 
 
 
436 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4732  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.48 
 
 
436 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2267  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.56 
 
 
419 aa  283  4.0000000000000003e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1225  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.12 
 
 
477 aa  280  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3644  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  40.39 
 
 
426 aa  276  6e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.329699  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3559  nucleotide sugar dehydrogenase  39.46 
 
 
461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0650  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.99 
 
 
425 aa  267  2e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.634824 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0249  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.83 
 
 
428 aa  265  8e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.066145 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1221  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  35.85 
 
 
410 aa  264  3e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00366346  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0796  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.89 
 
 
439 aa  263  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2529  nucleotide sugar dehydrogenase  38.07 
 
 
418 aa  263  4.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000174279 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4704  nucleotide sugar dehydrogenase  38.82 
 
 
425 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.963115  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0638  nucleotide sugar dehydrogenase  35.88 
 
 
436 aa  262  8.999999999999999e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1493  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.42 
 
 
423 aa  262  8.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887113 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2637  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.99 
 
 
425 aa  261  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5375  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.02 
 
 
425 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  37.6 
 
 
461 aa  260  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1431  nucleotide sugar dehydrogenase  38.46 
 
 
428 aa  260  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001773  UDP-glucose dehydrogenase  37.6 
 
 
426 aa  260  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.350291  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3997  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.72 
 
 
426 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0461  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  35.77 
 
 
410 aa  259  6e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.231921  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3392  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronic acid dehydrogenase  36.41 
 
 
432 aa  259  8e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  36.22 
 
 
425 aa  258  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.416504  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3288  nucleotide sugar dehydrogenase  36.09 
 
 
453 aa  258  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.178741  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1423  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.01 
 
 
421 aa  256  6e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.807918  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3190  polysaccharide biosynthesis protein  35.38 
 
 
426 aa  255  9e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29910  polysaccharide biosynthesis protein  36.25 
 
 
425 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00762868  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3259  nucleotide sugar dehydrogenase  38.2 
 
 
426 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4788  nucleotide sugar dehydrogenase  34.87 
 
 
421 aa  252  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406886 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0464  nucleotide sugar dehydrogenase  37.17 
 
 
430 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>