More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2833 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2833  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  100 
 
 
448 aa  919    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1480  nucleotide sugar dehydrogenase  56.08 
 
 
448 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.4016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1384  nucleotide sugar dehydrogenase  55.86 
 
 
448 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2474  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.28 
 
 
449 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323827  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1238  nucleotide sugar dehydrogenase  54.26 
 
 
437 aa  481  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.836268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4504  nucleotide sugar dehydrogenase  53.48 
 
 
451 aa  478  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1673  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  53.46 
 
 
435 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1857  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  54.03 
 
 
438 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1508  nucleotide sugar dehydrogenase  53.29 
 
 
434 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4103  nucleotide sugar dehydrogenase  54.98 
 
 
441 aa  455  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1299  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.67 
 
 
441 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.165052  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4292  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.76 
 
 
440 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4419  nucleotide sugar dehydrogenase  52.97 
 
 
440 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4429  nucleotide sugar dehydrogenase  54.99 
 
 
440 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3939  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  51.26 
 
 
505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809757  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4451  nucleotide sugar dehydrogenase  55.14 
 
 
441 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5249  nucleotide sugar dehydrogenase  52.79 
 
 
446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3256  nucleotide sugar dehydrogenase  52.41 
 
 
437 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4278  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  52.69 
 
 
441 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2167  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  53.21 
 
 
442 aa  442  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.959713  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0487  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50.89 
 
 
447 aa  441  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1818  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  53.17 
 
 
439 aa  435  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.387792  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3083  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.03 
 
 
435 aa  435  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5968  nucleotide sugar dehydrogenase  50.45 
 
 
445 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3827  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.43 
 
 
438 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.10325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1229  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  52.29 
 
 
442 aa  431  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.425997  normal  0.200381 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0575  nucleotide sugar dehydrogenase  52.48 
 
 
432 aa  435  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2396  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.11 
 
 
435 aa  427  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0961  nucleotide sugar dehydrogenase  49.88 
 
 
435 aa  426  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6764  nucleotide sugar dehydrogenase  52.25 
 
 
456 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0817646  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0023  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.42 
 
 
432 aa  424  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576582  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7121  nucleotide sugar dehydrogenase  51.12 
 
 
450 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168128  normal  0.1616 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1553  nucleotide sugar dehydrogenase  49.21 
 
 
440 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6571  nucleotide sugar dehydrogenase  50.34 
 
 
443 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.430897  normal  0.0960197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2863  nucleotide sugar dehydrogenase  48.76 
 
 
447 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1339  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.73 
 
 
434 aa  410  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0636  nucleotide sugar dehydrogenase  48.02 
 
 
439 aa  411  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4589  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.76 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338579  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0353  nucleotide sugar dehydrogenase  47.72 
 
 
434 aa  397  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0335  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.72 
 
 
434 aa  397  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0359  nucleotide sugar dehydrogenase  48.86 
 
 
439 aa  394  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0705  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.48 
 
 
438 aa  393  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000613921  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1675  nucleotide sugar dehydrogenase  47.78 
 
 
440 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160013  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0376  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.6 
 
 
420 aa  364  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2529  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.34 
 
 
439 aa  354  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3852  nucleotide sugar dehydrogenase  45.35 
 
 
453 aa  353  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199691  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0162  nucleotide sugar dehydrogenase  43.58 
 
 
420 aa  351  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.454835  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2856  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  44.29 
 
 
442 aa  349  7e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  hitchhiker  0.00000634421 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5667  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.25 
 
 
442 aa  348  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0209397 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26760  nucleotide sugar dehydrogenase  44.47 
 
 
416 aa  346  4e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6488  lipopolysaccharide biosynthesis protein  44.19 
 
 
419 aa  345  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1309  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.03 
 
 
450 aa  340  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0281238  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1688  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.78 
 
 
418 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833152  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0429  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.69 
 
 
423 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0509  putative polysaccharide biosynthesis protein  42.39 
 
 
413 aa  336  5e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05630  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  43.36 
 
 
417 aa  335  1e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3870  nucleotide sugar dehydrogenase  41.14 
 
 
442 aa  332  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7640  nucleotide sugar dehydrogenase  44.92 
 
 
418 aa  330  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0562  putative polysaccharide biosynthesis protein  43.09 
 
 
414 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0560  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  43.56 
 
 
414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0421  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  42.72 
 
 
414 aa  327  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0487  putative polysaccharide biosynthesis protein  42.86 
 
 
413 aa  326  5e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0417  UDP-N-acetyl-D-mannosamine 6-dehydrogenase  42.72 
 
 
414 aa  325  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0423  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.42 
 
 
414 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0240  nucleotide sugar dehydrogenase  38.96 
 
 
453 aa  318  9e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.836377  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2807  nucleotide sugar dehydrogenase  41.3 
 
 
428 aa  318  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2164  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.81 
 
 
471 aa  316  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4814  putative polysaccharide biosynthesis protein  41.45 
 
 
414 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3559  nucleotide sugar dehydrogenase  39.18 
 
 
461 aa  276  5e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1225  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.31 
 
 
477 aa  265  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3288  nucleotide sugar dehydrogenase  35.65 
 
 
453 aa  260  3e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.178741  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4644  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.53 
 
 
436 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4732  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.53 
 
 
436 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5027  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.53 
 
 
436 aa  259  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3843  nucleotide sugar dehydrogenase  37.87 
 
 
415 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0234219  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0929  nucleotide sugar dehydrogenase  38.54 
 
 
416 aa  256  4e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  36.75 
 
 
461 aa  253  5.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01511  VI polysaccharide biosynthesis protein VipA/tviB  37.44 
 
 
430 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.098059  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3187  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  38.5 
 
 
437 aa  249  6e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.878007  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0699  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.46 
 
 
419 aa  246  8e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136765  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3259  nucleotide sugar dehydrogenase  35.94 
 
 
426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0666  VI polysaccharide biosynthesis protein VipA/tviB  33.94 
 
 
423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.306604  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0464  nucleotide sugar dehydrogenase  37.84 
 
 
430 aa  242  7.999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148453  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0525  polysaccharide biosynthetic protein  37.84 
 
 
430 aa  241  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.163274  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0461  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  33.81 
 
 
410 aa  239  5e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.231921  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0638  nucleotide sugar dehydrogenase  35.38 
 
 
436 aa  239  5e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1423  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.49 
 
 
421 aa  238  2e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.807918  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0619  cellulose binding, type IV  35.93 
 
 
427 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001773  UDP-glucose dehydrogenase  35.09 
 
 
426 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.350291  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4704  nucleotide sugar dehydrogenase  36 
 
 
425 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.963115  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1221  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  34.52 
 
 
410 aa  236  8e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00366346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4949  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.12 
 
 
427 aa  235  9e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.094226  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3190  polysaccharide biosynthesis protein  34.34 
 
 
426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0613  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.15 
 
 
425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.144272 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2131  nucleotide sugar dehydrogenase  35.88 
 
 
417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1493  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.82 
 
 
423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887113 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0611  nucleotide sugar dehydrogenase  35.55 
 
 
429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15845  normal  0.0862821 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2529  nucleotide sugar dehydrogenase  35.91 
 
 
418 aa  234  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000174279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4077  nucleotide sugar dehydrogenase  35.78 
 
 
444 aa  234  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771769  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2415  nucleotide sugar dehydrogenase  34.97 
 
 
443 aa  233  5e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000438883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>