More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3827 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3827  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  100 
 
 
438 aa  907    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.10325  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1553  nucleotide sugar dehydrogenase  61.73 
 
 
440 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4504  nucleotide sugar dehydrogenase  53.7 
 
 
451 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3083  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.04 
 
 
435 aa  485  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2396  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.4 
 
 
435 aa  484  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0961  nucleotide sugar dehydrogenase  48.85 
 
 
435 aa  462  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1238  nucleotide sugar dehydrogenase  49.65 
 
 
437 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.836268  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3256  nucleotide sugar dehydrogenase  50 
 
 
437 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4103  nucleotide sugar dehydrogenase  50.92 
 
 
441 aa  449  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1384  nucleotide sugar dehydrogenase  51.38 
 
 
448 aa  448  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1480  nucleotide sugar dehydrogenase  51.15 
 
 
448 aa  448  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.4016  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2474  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.38 
 
 
449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323827  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0023  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.53 
 
 
432 aa  444  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1673  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50.59 
 
 
435 aa  441  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0335  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.31 
 
 
434 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0353  nucleotide sugar dehydrogenase  49.31 
 
 
434 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2833  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.43 
 
 
448 aa  436  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1508  nucleotide sugar dehydrogenase  48.12 
 
 
434 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0359  nucleotide sugar dehydrogenase  52.86 
 
 
439 aa  434  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6764  nucleotide sugar dehydrogenase  51.06 
 
 
456 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0817646  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4419  nucleotide sugar dehydrogenase  50.71 
 
 
440 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3939  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50.47 
 
 
505 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2863  nucleotide sugar dehydrogenase  50 
 
 
447 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4278  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50.12 
 
 
441 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4292  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.19 
 
 
440 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1339  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.28 
 
 
434 aa  421  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1857  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.2 
 
 
438 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4451  nucleotide sugar dehydrogenase  51.19 
 
 
441 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0487  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.06 
 
 
447 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4429  nucleotide sugar dehydrogenase  51.19 
 
 
440 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1229  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50.12 
 
 
442 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.425997  normal  0.200381 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0575  nucleotide sugar dehydrogenase  46.15 
 
 
432 aa  412  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0636  nucleotide sugar dehydrogenase  46.26 
 
 
439 aa  414  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6571  nucleotide sugar dehydrogenase  49.3 
 
 
443 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.430897  normal  0.0960197 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1675  nucleotide sugar dehydrogenase  50.8 
 
 
440 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160013  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5968  nucleotide sugar dehydrogenase  46.74 
 
 
445 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2167  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.3 
 
 
442 aa  396  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.959713  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7121  nucleotide sugar dehydrogenase  46.62 
 
 
450 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168128  normal  0.1616 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1299  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.44 
 
 
441 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.165052  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4589  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.11 
 
 
465 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338579  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5249  nucleotide sugar dehydrogenase  46.95 
 
 
446 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0705  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.58 
 
 
438 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000613921  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1818  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50.27 
 
 
439 aa  383  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.387792  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0162  nucleotide sugar dehydrogenase  45.01 
 
 
420 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.454835  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5667  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.83 
 
 
442 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0209397 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3870  nucleotide sugar dehydrogenase  43.81 
 
 
442 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0376  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.07 
 
 
420 aa  363  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2856  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  39.95 
 
 
442 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  hitchhiker  0.00000634421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3852  nucleotide sugar dehydrogenase  45.7 
 
 
453 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199691  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2529  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.14 
 
 
439 aa  360  2e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1688  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.41 
 
 
418 aa  351  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833152  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6488  lipopolysaccharide biosynthesis protein  46.14 
 
 
419 aa  349  5e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1309  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.32 
 
 
450 aa  348  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0281238  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0429  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.97 
 
 
423 aa  347  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26760  nucleotide sugar dehydrogenase  41.63 
 
 
416 aa  342  1e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7640  nucleotide sugar dehydrogenase  44.74 
 
 
418 aa  340  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0509  putative polysaccharide biosynthesis protein  40.62 
 
 
413 aa  329  7e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2807  nucleotide sugar dehydrogenase  41.48 
 
 
428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0560  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  41.59 
 
 
414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0417  UDP-N-acetyl-D-mannosamine 6-dehydrogenase  40.43 
 
 
414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05630  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  42.23 
 
 
417 aa  327  3e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0421  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  40.19 
 
 
414 aa  326  5e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0562  putative polysaccharide biosynthesis protein  40.77 
 
 
414 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0423  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.35 
 
 
414 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0487  putative polysaccharide biosynthesis protein  40.87 
 
 
413 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2164  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.1 
 
 
471 aa  324  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4814  putative polysaccharide biosynthesis protein  40.87 
 
 
414 aa  323  4e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0240  nucleotide sugar dehydrogenase  38.46 
 
 
453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.836377  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3843  nucleotide sugar dehydrogenase  39.4 
 
 
415 aa  277  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0234219  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1225  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.11 
 
 
477 aa  269  8.999999999999999e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3559  nucleotide sugar dehydrogenase  39.11 
 
 
461 aa  269  8.999999999999999e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5027  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.69 
 
 
436 aa  269  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4644  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.69 
 
 
436 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4732  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.69 
 
 
436 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1757  nucleotide sugar dehydrogenase  35.59 
 
 
437 aa  242  7.999999999999999e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5120  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  33.49 
 
 
427 aa  239  9e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5512  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  33.49 
 
 
427 aa  239  9e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3259  nucleotide sugar dehydrogenase  34.05 
 
 
426 aa  239  9e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5362  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  33.49 
 
 
427 aa  239  9e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01511  VI polysaccharide biosynthesis protein VipA/tviB  38.87 
 
 
430 aa  237  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.098059  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3008  nucleotide sugar dehydrogenase  36.03 
 
 
436 aa  237  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1854  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  36.04 
 
 
408 aa  236  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0701839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4967  N-acylmannosamine 1-dehydrogenase (UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase); capsular polysaccharide synthesis enzyme  32.63 
 
 
427 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0699  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.52 
 
 
419 aa  234  3e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136765  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2131  nucleotide sugar dehydrogenase  34.53 
 
 
417 aa  233  5e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0666  VI polysaccharide biosynthesis protein VipA/tviB  33.25 
 
 
423 aa  231  1e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.306604  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0929  nucleotide sugar dehydrogenase  34.87 
 
 
416 aa  232  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  35.29 
 
 
461 aa  232  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  33.89 
 
 
424 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0320263  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0633  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.57 
 
 
435 aa  231  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0638  nucleotide sugar dehydrogenase  34.05 
 
 
436 aa  230  4e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3288  nucleotide sugar dehydrogenase  34.05 
 
 
453 aa  229  6e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.178741  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3187  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  35.45 
 
 
437 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.878007  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2529  nucleotide sugar dehydrogenase  32.61 
 
 
418 aa  229  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000174279 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2254  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  35.97 
 
 
414 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3392  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronic acid dehydrogenase  32.65 
 
 
432 aa  228  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3644  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  31.33 
 
 
426 aa  226  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.329699  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0461  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  31.86 
 
 
410 aa  226  6e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.231921  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0525  polysaccharide biosynthetic protein  37.88 
 
 
430 aa  226  8e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.163274  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0178  nucleotide sugar dehydrogenase  32.94 
 
 
427 aa  226  9e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>