More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3256 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3256  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
437 aa  896    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1238  nucleotide sugar dehydrogenase  70.3 
 
 
437 aa  635    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.836268  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0636  nucleotide sugar dehydrogenase  63.01 
 
 
439 aa  552  1e-156  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0961  nucleotide sugar dehydrogenase  62.62 
 
 
435 aa  548  1e-155  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0353  nucleotide sugar dehydrogenase  61.65 
 
 
434 aa  533  1e-150  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0335  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.65 
 
 
434 aa  533  1e-150  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4504  nucleotide sugar dehydrogenase  58.41 
 
 
451 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1339  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.38 
 
 
434 aa  511  1e-144  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0023  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.01 
 
 
432 aa  501  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0705  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.78 
 
 
438 aa  501  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000613921  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0575  nucleotide sugar dehydrogenase  54.94 
 
 
432 aa  472  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2863  nucleotide sugar dehydrogenase  52.8 
 
 
447 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1553  nucleotide sugar dehydrogenase  51.97 
 
 
440 aa  467  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3827  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50 
 
 
438 aa  459  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.10325  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0359  nucleotide sugar dehydrogenase  55.21 
 
 
439 aa  460  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1673  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50.47 
 
 
435 aa  448  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1480  nucleotide sugar dehydrogenase  51.74 
 
 
448 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.4016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1384  nucleotide sugar dehydrogenase  51.74 
 
 
448 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2833  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  52.41 
 
 
448 aa  443  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4103  nucleotide sugar dehydrogenase  51.74 
 
 
441 aa  443  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3083  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.34 
 
 
435 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1857  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50.24 
 
 
438 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3939  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50.93 
 
 
505 aa  438  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809757  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2474  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.16 
 
 
449 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323827  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2396  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.42 
 
 
435 aa  438  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1675  nucleotide sugar dehydrogenase  53.66 
 
 
440 aa  433  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160013  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5968  nucleotide sugar dehydrogenase  51.03 
 
 
445 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1508  nucleotide sugar dehydrogenase  48.69 
 
 
434 aa  423  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1299  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.99 
 
 
441 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.165052  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4278  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50 
 
 
441 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6764  nucleotide sugar dehydrogenase  52.83 
 
 
456 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0817646  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4419  nucleotide sugar dehydrogenase  50.48 
 
 
440 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0487  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  51.17 
 
 
447 aa  415  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7121  nucleotide sugar dehydrogenase  49.66 
 
 
450 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168128  normal  0.1616 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2167  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  51.07 
 
 
442 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.959713  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3870  nucleotide sugar dehydrogenase  49.02 
 
 
442 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1818  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.76 
 
 
439 aa  411  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.387792  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6571  nucleotide sugar dehydrogenase  49.77 
 
 
443 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.430897  normal  0.0960197 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4589  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.12 
 
 
465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338579  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4451  nucleotide sugar dehydrogenase  50.71 
 
 
441 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4292  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.71 
 
 
440 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4429  nucleotide sugar dehydrogenase  51.19 
 
 
440 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0376  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.8 
 
 
420 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1229  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.55 
 
 
442 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.425997  normal  0.200381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5249  nucleotide sugar dehydrogenase  46.95 
 
 
446 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3852  nucleotide sugar dehydrogenase  47.91 
 
 
453 aa  391  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199691  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0162  nucleotide sugar dehydrogenase  45.28 
 
 
420 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.454835  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26760  nucleotide sugar dehydrogenase  48.78 
 
 
416 aa  384  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2856  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  43.46 
 
 
442 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  hitchhiker  0.00000634421 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5667  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.22 
 
 
442 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0209397 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2529  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.95 
 
 
439 aa  378  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1688  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  46.81 
 
 
418 aa  378  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833152  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6488  lipopolysaccharide biosynthesis protein  46.45 
 
 
419 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05630  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  45.07 
 
 
417 aa  371  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1309  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.83 
 
 
450 aa  363  4e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0281238  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2807  nucleotide sugar dehydrogenase  41.61 
 
 
428 aa  352  7e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0429  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.45 
 
 
423 aa  349  6e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0509  putative polysaccharide biosynthesis protein  41.11 
 
 
413 aa  346  5e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7640  nucleotide sugar dehydrogenase  45.83 
 
 
418 aa  342  7e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0560  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  40.77 
 
 
414 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2164  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.61 
 
 
471 aa  339  5.9999999999999996e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0562  putative polysaccharide biosynthesis protein  39.81 
 
 
414 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0417  UDP-N-acetyl-D-mannosamine 6-dehydrogenase  40.62 
 
 
414 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0421  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  40.14 
 
 
414 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0240  nucleotide sugar dehydrogenase  40.72 
 
 
453 aa  336  5.999999999999999e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.836377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0487  putative polysaccharide biosynthesis protein  40.38 
 
 
413 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4814  putative polysaccharide biosynthesis protein  39.28 
 
 
414 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0423  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.55 
 
 
414 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5027  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  46.37 
 
 
436 aa  307  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4644  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  46.37 
 
 
436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4732  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  46.37 
 
 
436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1225  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.69 
 
 
477 aa  295  9e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3559  nucleotide sugar dehydrogenase  40.54 
 
 
461 aa  288  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3843  nucleotide sugar dehydrogenase  44.68 
 
 
415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0234219  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  39.71 
 
 
461 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0210  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.66 
 
 
440 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.125805  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3288  nucleotide sugar dehydrogenase  39.34 
 
 
453 aa  278  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.178741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3259  nucleotide sugar dehydrogenase  37.06 
 
 
426 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5563  NDP-N-acetyl-D-galactosaminuronic acid dehydrogenase  38.73 
 
 
427 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2494  nucleotide sugar dehydrogenase  41.34 
 
 
438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4949  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.68 
 
 
427 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.094226  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0666  VI polysaccharide biosynthesis protein VipA/tviB  40.17 
 
 
423 aa  266  8e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.306604  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3187  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  41.03 
 
 
437 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.878007  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2267  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.34 
 
 
419 aa  265  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1312  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.91 
 
 
437 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3008  nucleotide sugar dehydrogenase  37.41 
 
 
436 aa  264  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3190  polysaccharide biosynthesis protein  36.96 
 
 
426 aa  262  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2415  nucleotide sugar dehydrogenase  41.67 
 
 
443 aa  261  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000438883 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1397  VI polysaccharide biosynthesis protein VipA/tviB  36.66 
 
 
405 aa  261  2e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0249  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.11 
 
 
428 aa  260  3e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.066145 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0638  nucleotide sugar dehydrogenase  36.28 
 
 
436 aa  260  3e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2441  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.39 
 
 
428 aa  260  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  35.65 
 
 
424 aa  259  7e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0320263  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0098  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.13 
 
 
426 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.15381  normal  0.264106 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0623  nucleotide sugar dehydrogenase  38.29 
 
 
432 aa  258  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.786089  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0929  nucleotide sugar dehydrogenase  39.59 
 
 
416 aa  258  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2304  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.83 
 
 
457 aa  258  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1910  nucleotide sugar dehydrogenase  37.44 
 
 
437 aa  257  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1757  nucleotide sugar dehydrogenase  40.68 
 
 
437 aa  257  4e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1591  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.94 
 
 
431 aa  256  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117032  normal  0.926821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>