More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2167 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2167  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  100 
 
 
442 aa  907    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.959713  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1480  nucleotide sugar dehydrogenase  57.27 
 
 
448 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.4016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1384  nucleotide sugar dehydrogenase  57.05 
 
 
448 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2474  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.92 
 
 
449 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1673  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  56.67 
 
 
435 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4103  nucleotide sugar dehydrogenase  58.25 
 
 
441 aa  493  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1299  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.74 
 
 
441 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.165052  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4429  nucleotide sugar dehydrogenase  58.81 
 
 
440 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1238  nucleotide sugar dehydrogenase  53.61 
 
 
437 aa  472  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.836268  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4451  nucleotide sugar dehydrogenase  58.57 
 
 
441 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4278  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  55.61 
 
 
441 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4292  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.1 
 
 
440 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5249  nucleotide sugar dehydrogenase  55.01 
 
 
446 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1857  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  53.05 
 
 
438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2833  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  54.36 
 
 
448 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1508  nucleotide sugar dehydrogenase  53.21 
 
 
434 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4419  nucleotide sugar dehydrogenase  53.66 
 
 
440 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1818  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  54.98 
 
 
439 aa  457  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.387792  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4504  nucleotide sugar dehydrogenase  52.04 
 
 
451 aa  458  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1229  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  53.65 
 
 
442 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.425997  normal  0.200381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3083  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.72 
 
 
435 aa  444  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3939  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  52.3 
 
 
505 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809757  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6764  nucleotide sugar dehydrogenase  54.93 
 
 
456 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0817646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2396  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.59 
 
 
435 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3256  nucleotide sugar dehydrogenase  51.07 
 
 
437 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0961  nucleotide sugar dehydrogenase  49.88 
 
 
435 aa  432  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0487  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  51.61 
 
 
447 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5968  nucleotide sugar dehydrogenase  51.9 
 
 
445 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0353  nucleotide sugar dehydrogenase  49.54 
 
 
434 aa  425  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0335  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.54 
 
 
434 aa  425  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6571  nucleotide sugar dehydrogenase  53.18 
 
 
443 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.430897  normal  0.0960197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2863  nucleotide sugar dehydrogenase  48.82 
 
 
447 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3827  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.3 
 
 
438 aa  416  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.10325  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0575  nucleotide sugar dehydrogenase  50.24 
 
 
432 aa  418  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7121  nucleotide sugar dehydrogenase  51.42 
 
 
450 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168128  normal  0.1616 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0636  nucleotide sugar dehydrogenase  48.94 
 
 
439 aa  412  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0023  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.71 
 
 
432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576582  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0359  nucleotide sugar dehydrogenase  48.84 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1339  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.14 
 
 
434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1675  nucleotide sugar dehydrogenase  48.51 
 
 
440 aa  402  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160013  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1553  nucleotide sugar dehydrogenase  49.88 
 
 
440 aa  403  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4589  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.47 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338579  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0376  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.86 
 
 
420 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3870  nucleotide sugar dehydrogenase  45.71 
 
 
442 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0162  nucleotide sugar dehydrogenase  47.2 
 
 
420 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.454835  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0705  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.89 
 
 
438 aa  362  8e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000613921  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2529  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.98 
 
 
439 aa  361  1e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3852  nucleotide sugar dehydrogenase  45.5 
 
 
453 aa  361  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199691  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0429  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.2 
 
 
423 aa  360  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1309  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.89 
 
 
450 aa  360  3e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0281238  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0509  putative polysaccharide biosynthesis protein  44.07 
 
 
413 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1688  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.31 
 
 
418 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833152  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26760  nucleotide sugar dehydrogenase  43.55 
 
 
416 aa  346  4e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0240  nucleotide sugar dehydrogenase  41.88 
 
 
453 aa  345  1e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.836377  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5667  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.18 
 
 
442 aa  344  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0209397 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2807  nucleotide sugar dehydrogenase  42.24 
 
 
428 aa  340  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0560  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  43.03 
 
 
414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0562  putative polysaccharide biosynthesis protein  42.69 
 
 
414 aa  336  5e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2856  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  42.45 
 
 
442 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  hitchhiker  0.00000634421 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0417  UDP-N-acetyl-D-mannosamine 6-dehydrogenase  42.62 
 
 
414 aa  333  4e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0487  putative polysaccharide biosynthesis protein  42.21 
 
 
413 aa  332  6e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4814  putative polysaccharide biosynthesis protein  42.79 
 
 
414 aa  332  6e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0421  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  42.13 
 
 
414 aa  330  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0423  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.13 
 
 
414 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2164  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.17 
 
 
471 aa  330  4e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6488  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.12 
 
 
419 aa  322  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7640  nucleotide sugar dehydrogenase  43.86 
 
 
418 aa  319  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05630  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  40.39 
 
 
417 aa  311  1e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3559  nucleotide sugar dehydrogenase  41.93 
 
 
461 aa  291  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1225  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.65 
 
 
477 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4644  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44 
 
 
436 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4732  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44 
 
 
436 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5027  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44 
 
 
436 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3843  nucleotide sugar dehydrogenase  40.64 
 
 
415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0234219  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3259  nucleotide sugar dehydrogenase  35.51 
 
 
426 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2267  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.93 
 
 
419 aa  263  6e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0623  nucleotide sugar dehydrogenase  39.47 
 
 
432 aa  262  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.786089  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  36.93 
 
 
425 aa  260  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.416504  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1550  nucleotide sugar dehydrogenase  39.29 
 
 
424 aa  260  3e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.896349  normal  0.523869 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3190  polysaccharide biosynthesis protein  36.34 
 
 
426 aa  259  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1221  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  36.1 
 
 
410 aa  259  8e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00366346  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001773  UDP-glucose dehydrogenase  36.59 
 
 
426 aa  258  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.350291  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3997  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.25 
 
 
426 aa  257  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0232  nucleotide sugar dehydrogenase  39.21 
 
 
427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0666  VI polysaccharide biosynthesis protein VipA/tviB  35.97 
 
 
423 aa  253  3e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.306604  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1493  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.68 
 
 
423 aa  253  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887113 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1397  VI polysaccharide biosynthesis protein VipA/tviB  35.61 
 
 
405 aa  252  9.000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2440  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  38.69 
 
 
426 aa  252  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.406564  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3187  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  37.78 
 
 
437 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.878007  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0461  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  35.12 
 
 
410 aa  251  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.231921  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0929  nucleotide sugar dehydrogenase  38.42 
 
 
416 aa  251  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3130  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37 
 
 
433 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0638  nucleotide sugar dehydrogenase  35.71 
 
 
436 aa  251  1e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0611  nucleotide sugar dehydrogenase  37.31 
 
 
429 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15845  normal  0.0862821 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4704  nucleotide sugar dehydrogenase  36.69 
 
 
425 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.963115  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3069  nucleotide sugar dehydrogenase  41.85 
 
 
426 aa  250  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0650  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.61 
 
 
425 aa  249  5e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.634824 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3644  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  33.89 
 
 
426 aa  249  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.329699  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1423  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.18 
 
 
421 aa  249  6e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.807918  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0249  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.63 
 
 
428 aa  249  7e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.066145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>