More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0359 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0359  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
439 aa  899    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1675  nucleotide sugar dehydrogenase  72.05 
 
 
440 aa  622  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160013  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4504  nucleotide sugar dehydrogenase  59.76 
 
 
451 aa  536  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3870  nucleotide sugar dehydrogenase  60.24 
 
 
442 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1238  nucleotide sugar dehydrogenase  56.05 
 
 
437 aa  510  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.836268  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0335  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.99 
 
 
434 aa  483  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0353  nucleotide sugar dehydrogenase  55.99 
 
 
434 aa  483  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3256  nucleotide sugar dehydrogenase  55.21 
 
 
437 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0023  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.6 
 
 
432 aa  476  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576582  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1384  nucleotide sugar dehydrogenase  53.13 
 
 
448 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0961  nucleotide sugar dehydrogenase  52.25 
 
 
435 aa  466  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2396  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.12 
 
 
435 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1480  nucleotide sugar dehydrogenase  52.9 
 
 
448 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.4016  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0636  nucleotide sugar dehydrogenase  52.73 
 
 
439 aa  464  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3083  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.16 
 
 
435 aa  462  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1553  nucleotide sugar dehydrogenase  52.33 
 
 
440 aa  464  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1339  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.04 
 
 
434 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0705  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.92 
 
 
438 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000613921  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3827  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  52.86 
 
 
438 aa  459  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.10325  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2474  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.85 
 
 
449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323827  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2863  nucleotide sugar dehydrogenase  49.29 
 
 
447 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0575  nucleotide sugar dehydrogenase  50.23 
 
 
432 aa  441  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1673  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50.59 
 
 
435 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4419  nucleotide sugar dehydrogenase  50.24 
 
 
440 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4103  nucleotide sugar dehydrogenase  48.12 
 
 
441 aa  420  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3939  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.65 
 
 
505 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809757  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2833  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.86 
 
 
448 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5968  nucleotide sugar dehydrogenase  48.05 
 
 
445 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1857  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  46.45 
 
 
438 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1299  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.28 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.165052  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5249  nucleotide sugar dehydrogenase  48.69 
 
 
446 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1818  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  46.01 
 
 
439 aa  403  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.387792  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4278  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.56 
 
 
441 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2167  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.84 
 
 
442 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.959713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1508  nucleotide sugar dehydrogenase  45.69 
 
 
434 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7121  nucleotide sugar dehydrogenase  47.82 
 
 
450 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168128  normal  0.1616 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0487  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.07 
 
 
447 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6571  nucleotide sugar dehydrogenase  47.93 
 
 
443 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.430897  normal  0.0960197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6764  nucleotide sugar dehydrogenase  49.29 
 
 
456 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0817646  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4292  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.8 
 
 
440 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4589  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.17 
 
 
465 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338579  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1229  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.46 
 
 
442 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.425997  normal  0.200381 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4429  nucleotide sugar dehydrogenase  49.28 
 
 
440 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4451  nucleotide sugar dehydrogenase  48.82 
 
 
441 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0162  nucleotide sugar dehydrogenase  45.02 
 
 
420 aa  363  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.454835  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0376  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.3 
 
 
420 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6488  lipopolysaccharide biosynthesis protein  47.33 
 
 
419 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5667  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.77 
 
 
442 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0209397 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26760  nucleotide sugar dehydrogenase  45.12 
 
 
416 aa  356  3.9999999999999996e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2856  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  39.14 
 
 
442 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  hitchhiker  0.00000634421 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1688  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.55 
 
 
418 aa  351  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833152  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3852  nucleotide sugar dehydrogenase  44.77 
 
 
453 aa  350  4e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199691  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2529  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.86 
 
 
439 aa  347  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05630  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  44.47 
 
 
417 aa  346  4e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0429  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.96 
 
 
423 aa  342  8e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1309  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.96 
 
 
450 aa  339  5e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0281238  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0509  putative polysaccharide biosynthesis protein  40 
 
 
413 aa  335  7e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7640  nucleotide sugar dehydrogenase  43.91 
 
 
418 aa  334  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0562  putative polysaccharide biosynthesis protein  40.49 
 
 
414 aa  325  9e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2164  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.8 
 
 
471 aa  324  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0560  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  40.24 
 
 
414 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0417  UDP-N-acetyl-D-mannosamine 6-dehydrogenase  40.54 
 
 
414 aa  320  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0421  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  40.29 
 
 
414 aa  319  5e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0487  putative polysaccharide biosynthesis protein  40 
 
 
413 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4814  putative polysaccharide biosynthesis protein  39.32 
 
 
414 aa  317  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0240  nucleotide sugar dehydrogenase  40.45 
 
 
453 aa  316  7e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.836377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0423  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.35 
 
 
414 aa  312  9e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2807  nucleotide sugar dehydrogenase  36.09 
 
 
428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3843  nucleotide sugar dehydrogenase  44.78 
 
 
415 aa  307  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0234219  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3559  nucleotide sugar dehydrogenase  41.43 
 
 
461 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1225  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.13 
 
 
477 aa  287  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4644  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.95 
 
 
436 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4732  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.95 
 
 
436 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5027  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.95 
 
 
436 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0619  cellulose binding, type IV  39.13 
 
 
427 aa  256  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0461  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  36.57 
 
 
410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.231921  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2529  nucleotide sugar dehydrogenase  37.07 
 
 
418 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000174279 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5362  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  36.12 
 
 
427 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5120  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  36.12 
 
 
427 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5512  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  36.12 
 
 
427 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  36.17 
 
 
424 aa  250  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0320263  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1397  VI polysaccharide biosynthesis protein VipA/tviB  35.73 
 
 
405 aa  249  6e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4967  N-acylmannosamine 1-dehydrogenase (UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase); capsular polysaccharide synthesis enzyme  35.41 
 
 
427 aa  249  9e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3187  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  36.66 
 
 
437 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.878007  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2440  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  37.37 
 
 
426 aa  247  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.406564  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1221  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  35.46 
 
 
410 aa  247  3e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00366346  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3259  nucleotide sugar dehydrogenase  38.73 
 
 
426 aa  247  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3069  nucleotide sugar dehydrogenase  37.77 
 
 
426 aa  246  4.9999999999999997e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1423  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.29 
 
 
421 aa  246  6.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.807918  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01511  VI polysaccharide biosynthesis protein VipA/tviB  36.78 
 
 
430 aa  246  8e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.098059  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2415  nucleotide sugar dehydrogenase  37.72 
 
 
443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000438883 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0910  UDP-N-acetyl-D-galactosamine 6-dehydrogenase  34.62 
 
 
429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2267  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.08 
 
 
419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1105  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  34.62 
 
 
429 aa  244  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0623  nucleotide sugar dehydrogenase  35.6 
 
 
432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.786089  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0633  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.56 
 
 
435 aa  242  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0796  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.42 
 
 
439 aa  240  5e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3130  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.62 
 
 
433 aa  240  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1016  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  36.58 
 
 
423 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.61367  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3392  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronic acid dehydrogenase  35.32 
 
 
432 aa  239  9e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.0970629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>