More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2659 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2659  pirin domain-containing protein  100 
 
 
335 aa  696    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.12893 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3993  pirin domain-containing protein  56.21 
 
 
366 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347304  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4775  Pirin-like  55.13 
 
 
363 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.054663  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3130  hypothetical protein  51.82 
 
 
338 aa  372  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.828286  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4605  pirin domain-containing protein  54.9 
 
 
349 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.738915  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5250  Pirin domain protein  54.68 
 
 
390 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00018028  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2634  pirin domain-containing protein  51.81 
 
 
339 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00219854  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6112  Pirin domain protein  55.18 
 
 
339 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3965  pirin domain-containing protein  55.39 
 
 
347 aa  363  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal  0.318513 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3315  Pirin domain protein  55.39 
 
 
347 aa  363  2e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0908  pirin domain-containing protein  52.99 
 
 
348 aa  358  7e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34715  predicted protein  51.02 
 
 
352 aa  325  5e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.343605  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0441  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  44.85 
 
 
348 aa  322  5e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29089  predicted protein  48.91 
 
 
335 aa  298  7e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  38.43 
 
 
292 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  38.21 
 
 
290 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  38.43 
 
 
286 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  38.84 
 
 
287 aa  149  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  37.65 
 
 
286 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  37.19 
 
 
293 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  36.73 
 
 
290 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  37.65 
 
 
286 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  35.66 
 
 
288 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  37.65 
 
 
286 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  35.66 
 
 
288 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  37.65 
 
 
286 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  35.83 
 
 
290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  35.25 
 
 
288 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  36.63 
 
 
293 aa  146  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  37.14 
 
 
288 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  37.14 
 
 
288 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  35.77 
 
 
288 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  37.4 
 
 
288 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  37.55 
 
 
288 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  37.5 
 
 
318 aa  143  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  36.78 
 
 
288 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0744  pirin domain-containing protein  38.11 
 
 
285 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3276  pirin domain-containing protein  38.11 
 
 
285 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  36.36 
 
 
288 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  36.36 
 
 
288 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  36.36 
 
 
288 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  36.36 
 
 
288 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  36.36 
 
 
288 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  36.36 
 
 
288 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  36.36 
 
 
288 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0895  pirin family protein  38.06 
 
 
285 aa  142  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  34.43 
 
 
288 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  36.59 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  36.36 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  36.4 
 
 
288 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  37.6 
 
 
279 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3385  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  37.65 
 
 
285 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0892  Pirin domain protein  39.02 
 
 
285 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  40.08 
 
 
283 aa  139  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  35.15 
 
 
286 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  34.85 
 
 
286 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  35.95 
 
 
293 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  35.83 
 
 
305 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0792  pirin family protein  33.73 
 
 
293 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  37.97 
 
 
285 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  33.9 
 
 
286 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  37.59 
 
 
303 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  35.2 
 
 
293 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3469  pirin domain-containing protein  38.62 
 
 
285 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  38.08 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0902  pirin domain-containing protein  38.74 
 
 
290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  35.63 
 
 
302 aa  137  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0867  pirin domain-containing protein  39.02 
 
 
285 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  35.39 
 
 
289 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  35.39 
 
 
289 aa  137  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  35.39 
 
 
289 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  34.68 
 
 
290 aa  136  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3111  pirin domain-containing protein  37.5 
 
 
295 aa  135  8e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  37.75 
 
 
286 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  36.29 
 
 
286 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  35.42 
 
 
285 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  35.6 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  36.21 
 
 
285 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  36.99 
 
 
286 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  36.8 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  36.18 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  36.29 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  34.98 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  31.54 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  36.51 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  34.24 
 
 
295 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  36.67 
 
 
284 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  35.68 
 
 
293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  34.94 
 
 
287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  34.44 
 
 
295 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  37.4 
 
 
283 aa  132  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  35.39 
 
 
291 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  35.54 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  36.92 
 
 
309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  35.77 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4321  pirin domain-containing protein  34.57 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6985  Pirin domain protein  35.56 
 
 
287 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.16689  hitchhiker  0.00000014497 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  36.36 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  37.7 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  37.7 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>