More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4775 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4775  Pirin-like  100 
 
 		 363 aa  737    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.054663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3993  pirin domain-containing protein  79.24 
 
 		 366 aa  553  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5250  Pirin domain protein  75.36 
 
 		 390 aa  531  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00018028  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4605  pirin domain-containing protein  70.62 
 
 		 349 aa  477  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.738915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3315  Pirin domain protein  66.96 
 
 		 347 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3965  pirin domain-containing protein  66.96 
 
 		 347 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal  0.318513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0908  pirin domain-containing protein  65.98 
 
 		 348 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3130  hypothetical protein  55.13 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.828286  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2659  pirin domain-containing protein  55.13 
 
 		 335 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.12893 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6112  Pirin domain protein  57.31 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2634  pirin domain-containing protein  49.27 
 
 		 339 aa  352  4e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00219854  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0441  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  45.76 
 
 		 348 aa  328  9e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29089  predicted protein  49.4 
 
 		 335 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34715  predicted protein  47.38 
 
 		 352 aa  305  1.0000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.343605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  39.2 
 
 		 288 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  39.2 
 
 		 288 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  39.2 
 
 		 288 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  39.2 
 
 		 288 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  39.2 
 
 		 288 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  39.2 
 
 		 288 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  39.2 
 
 		 288 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  38.87 
 
 		 288 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  38.4 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  38.31 
 
 		 295 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  37.3 
 
 		 284 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  39.68 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  38.4 
 
 		 292 aa  150  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  36.84 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  37.25 
 
 		 288 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  37.25 
 
 		 288 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  38.55 
 
 		 288 aa  149  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  36.25 
 
 		 288 aa  149  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  35.43 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  36.29 
 
 		 288 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  38.15 
 
 		 295 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  37.3 
 
 		 285 aa  146  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  35.33 
 
 		 286 aa  146  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  36.44 
 
 		 288 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  36.44 
 
 		 288 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  35.32 
 
 		 284 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  34.55 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  37.1 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3217  pirin domain-containing protein  38.74 
 
 		 288 aa  143  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  35.18 
 
 		 293 aa  143  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  37.65 
 
 		 287 aa  143  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  38.31 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  35.6 
 
 		 284 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  36.29 
 
 		 288 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  37.65 
 
 		 285 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  38.15 
 
 		 294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  35.69 
 
 		 289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  38.15 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  35.69 
 
 		 289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  38.71 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  35.48 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  35.69 
 
 		 289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  36.29 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  33.86 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  36.11 
 
 		 286 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  37.25 
 
 		 293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  36.11 
 
 		 286 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  36.11 
 
 		 286 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  37.75 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  36.11 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  36.11 
 
 		 286 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  33.33 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2994  pirin family protein  38.1 
 
 		 284 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  40.23 
 
 		 286 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  36.4 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  33.06 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  39.37 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  38.02 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  35.77 
 
 		 282 aa  137  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  37.1 
 
 		 293 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  33.33 
 
 		 287 aa  137  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  35.6 
 
 		 280 aa  136  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  36.25 
 
 		 286 aa  135  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  36.33 
 
 		 301 aa  135  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  38.17 
 
 		 298 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  38.31 
 
 		 283 aa  135  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  36.61 
 
 		 293 aa  135  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  34.84 
 
 		 286 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  38.98 
 
 		 286 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  35.19 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  31.33 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  37.9 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6985  Pirin domain protein  34.27 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.16689  hitchhiker  0.00000014497 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  35.48 
 
 		 293 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  34.51 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  35.63 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3385  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  36.25 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  35.32 
 
 		 288 aa  134  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000589  pirin-related protein  36.25 
 
 		 282 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0425395  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  37.69 
 
 		 310 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1135  Pirin-like protein  38.78 
 
 		 282 aa  132  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120417  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  35.98 
 
 		 274 aa  132  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0895  pirin family protein  35.71 
 
 		 285 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  36.64 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  36.57 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  36.57 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>